医療統計でお勧めのソフト
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| 医療統計でお勧めのソフト [2017/11/21] – [医療統計でお勧めのソフト] adash333 | 医療統計でお勧めのソフト [2020/04/10] (現在) – [リンク] adash333 | ||
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| - | 「〇〇という疾患の20例」のような学会発表や論文を書くときに必要になってくるのが「統計ソフト」という代物です。エクセルは有料ですが、どこにでもインストールされていることが多く、平均や標準偏差を求めたり、簡単なグラフを描くのには十分な統計ソフトと言えると思います。ただ、ｔ検定などの、２つのグループ間の平均値に有意差があるかどうかなどの検定をエクセルで繰り返し行うのは面倒です。 | + | 「〇〇という疾患の20例」のような学会発表や論文を書くときに必要になってくるのが「統計ソフト」という代物です。エクセル(Microsoft Excel)は有料ですが、どこにでもインストールされていることが多く、平均や標準偏差を求めたり、簡単なグラフを描くのには十分な統計ソフトと言えると思います。本サイトでもエクセルを用いた統計の解説をさせていただきます。ただ、ｔ検定などの、２つのグループ間の平均値に有意差があるかどうかなどの検定をエクセルで繰り返し行うのは面倒です。 |
| - | エクセルに加えてt検定や重回帰分析を行う際の統計ソフトの候補としては | + | 2017年時点で、医療統計に用いることができる主なソフトとしては、 |
| + | - Microsoft Excel | ||
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| - | - EZR | + | - [[http:// |
| - R | - R | ||
| - JMP | - JMP | ||
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| が挙げられます。どのソフトも英語論文での実績はありますが、後半の3つは価格が数万円と高く、潤沢な研究費を持っている人でないと事実上使用不可能です。 | が挙げられます。どのソフトも英語論文での実績はありますが、後半の3つは価格が数万円と高く、潤沢な研究費を持っている人でないと事実上使用不可能です。 | ||
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| + | ==== 4Stepsエクセル統計 ==== | ||
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| Statcel 4 software, OMS Publishing Inc., Saitama, Japan | Statcel 4 software, OMS Publishing Inc., Saitama, Japan | ||
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| - | と記載すればよいようです。お勧めです。[[http:// | + | と記載すればよいようです。お勧めです。[[http:// |
| - | EZRは、プログラミング言語Rを発展させて、クリック操作だけで統計解析を行うことができるようにしたフリーソフトです。Windowsパソコンであれば、インストールも簡単です。唯一の難点は、エクセルで集めたデータを、一度、csvファイルに変換してから、EZRに取り込むのが、多少、面倒なところです。2017年現在、筆者はこれを愛用しています。 | + | ==== EZR ==== |
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| + | EZR]]は、プログラミング言語Rを発展させて、クリック操作だけで統計解析を行うことができるようにしたフリーソフトです。Windowsパソコンであれば、インストールも簡単です。もちろんMacでも使用することができます。唯一の難点は、エクセルで集めたデータを、一度、csvファイルに変換してから、EZRに取り込むのが、多少、面倒なところです。2017年現在、筆者はこれを愛用しています。 | ||
| + | 初めて統計をしようとする人にとっては、『どのようなときに、どの手法を使えばよいのか？』というところが分からないものです。しかし、2015年に発売された[[http:// | ||
| + | この本を一冊読めばそれで十分なのですが、それだとこのサイトに書くことがなくなってしまうので、よく使う項目だけでも、解説させて頂きたいと思います。 | ||
| + | ちなみに、論文のMethodには、 | ||
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| + | All statistical analyses were performed with EZR (Saitama Medical Center, Jichi Medical University, Saitama, Japan), a graphical user interface for R 2.13.0 (R Foundation for Statistical Computing, Vienna, Austria) [19]. More precisely, EZR is a modified version of R commander (version 1.6-3) designed to add statistical functions used frequently used in biostatistics. | ||
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| + | と記載すればよいようです。 | ||
| + | 引用文献としては、以下を記載すればよいそうです。 | ||
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| + | Bone Marrow Transplantation 2013: 48, 452–458 | ||
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| + | R言語（あーるげんご）はオープンソース・フリーソフトウェアの統計解析向けのプログラミング言語です。 | ||
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| + | 通常は上記のEZRを使えば十分なのですが、解析の経過を文章で残したかったり、後で確認したい場合に、R Studioというフリーソフトを用いてR markdown記法でレポートを記載しておくと便利です。 | ||
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| + | プログラミングをやったことがない方には非常にとっつきにくいかもしれませんが、将来的にはこちらを解説させて頂きたいと思います。 | ||
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| + | R markdownについては、以下のサイトが非常にお勧めです。 | ||
| + | |||
| + | 連載 | ||
| + | R Markdownで楽々レポートづくり\\ | ||
| + | http:// | ||
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| + | 論文のMethodに記載するときの例を以下に挙げておきます。 | ||
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| + | The statistical analysis was performed using R, version 3.3.1 (2016-06-21). | ||
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| + | R Core Team. (2016). R: A language and environment for statistical computing(Version 3.3.1, 2016-06-21, svn rev 70800). Vienna, Austria: R Foundation for Statistical Computing. Retrieved from www.R-project.org/ | ||
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| ===== リンク ===== | ===== リンク ===== | ||
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| - | [[Excelで平均値と標準誤差]] | + | [[初めての医療統計: |
| - | </ | + | |
| - | [[sidebar|初めての医療統計 目次]]\\ | + | |
医療統計でお勧めのソフト.1511263438.txt.gz · 最終更新: 2018/10/07 (外部編集)