====== WindowsにImageJをインストール ====== ===== リスト ===== [[imagej:02_画像から数値へ|02_画像から数値へ]] [[imagej:03_数値から画像へ|03 数値から画像へ]] [[imagej:04_2点間の距離を測定|04 2点間の距離を測定]] [[imagej:05_画像の2値化|05　画像の2値化]] ===== Windows10にImageJ（Fiji）をインストール ===== 以下の本を参考に、Windowsパソコンに、ImageJをインストールしてみます。 P270の付録１を参考に、Fijiというものをインストールしてみたい。 2014年から、ImageJ2というものがあるらしい。。。どっちをインストールするのかはこれから考えます。 ===== 開発環境 ===== Windows8.1 Pro 今回構築した環境 {{:pasted:20190414-064059.png}} ===== ImageJ（Fiji）のインストール ===== ImageJ本体に、ある程度プラグインを付属したものが、Fijiというものだそうです。初心者は、とりあえず、Fijiをインストールすればよいと思われます。 *C:/ フォルダに、C:/software/ フォルダを作成しておきます。 *Fijiのサイトhttps://imagej.net/Fiji/Downloads へ行きます。 {{:pasted:20190414-060743.png}} *Windowsのマークの64bitの方をクリックして、インストーラーをダウンロードします。 *インストーラーは、2019/4/14時点では、fiji-win64.zipという名前で、289MBあり、私の環境ではダウンロードに10分程度かかりました。 *ダウンロードできたら、ダブルクリックして、ZIPファイルを解凍 {{:pasted:20190414-062601.png}} *中身のFiji.appフォルダを、C:/software/ フォルダ（または、デスクトップ）に移動（コピー） *C:/software/Fiji.app/ フォルダの中の、ImageJ-win64.exe　をダブルクリックすると、ImageJ(Fiji)が起動します。（特にインストールなどは必要ありません。） {{:pasted:20190414-063746.png}} *以下のようなツールバーが表示されます。このツールバーから、いろいろな操作を行うことになります。 {{:pasted:20190414-063859.png}} ===== ImageJ（Fiji）のプラグインのアップデートとインストール ===== [[https://amzn.to/2UXl5jd|ImageJではじめる生物画像解析(2016/3/26)]]のP13の、「解析の準備」に従い、Fijiでのプラグインのアップデートとインストールを行ってみます。 *C:/software/Fiji.app/ImageJ-win64.exe をダブルクリックして、ImageJを起動。 {{:pasted:20190414-064642.png}} *Help > Update... をクリック {{:pasted:20190414-065225.png}} *自動的にUpdateされるので、しばらく待ちます {{:pasted:20190414-065306.png}} *Updateが終了すると、以下のような画面になるので、画面左下の"Manage update sites"をクリック {{:pasted:20190414-065714.png}} *Manage update sitesの画面が出てくるので、少し下の方へ行き、"CMCI-EMBL"のチャックボックスをONにします。 {{:pasted:20190414-065843.png}} {{:pasted:20190414-065907.png}} *画面右下の"Close"をクリックすると、以下のような画面になるので、画面下の"Apply changes"をクリック。 *すると、数秒で以下のような画面になるので、"OK"をクリックします。 {{:pasted:20190414-070139.png}} *ImageJのメニューバーで、File > Quit　をクリックして、ImageJを終了します。 {{:pasted:20190414-070342.png}} *C:/software/Fiji.app/ImageJ-win64.exe をダブルクリックして、ImageJを起動します。上記の操作により、ImageJのプラグインのアップデートと、CMCI-EMBLプラグインのインストールを行うことができました。 {{:pasted:20190414-070751.png}} *ImageJを起動すると、メニューバーの一番右に、"EMBL"という項目が増えています。 {{:pasted:20190414-071017.png}} ===== 参考 ===== Fiji Updaterについて https://imagej.net/Updater {{:pasted:20190414-065113.png}} ===== 参考リンク ===== http://scienceandtechnology.jp/archives/25990 Image J / Fiji のダウンロード方法、インストール方法と使い方 2019/01/11 2019/04/05 ===== リンク ===== [[imagej:index.html|imagej:index.html]] 次：[[imagej:02_画像から数値へ|imagej:02_画像から数値へ]]