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--- windowsにrstudioをインストール [2017/12/06] – [論文掲載可能なフリーソフトEZR] adash333
+++ windowsにrstudioをインストール [2018/10/07] – 外部編集 127.0.0.1
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-===== WindowsにRStudioをインストール =====
+===== R Studioとは？ =====
-統計の計算であれば、よほどのことをしない限りは、[[http://www.jichi.ac.jp/saitama-sct/SaitamaHP.files/statmed.html|
+統計の計算をしたいのであれば、よほどのことをしない限りは、[[http://www.jichi.ac.jp/saitama-sct/SaitamaHP.files/statmed.html|
 EZR]]で十分です。
+<html>
+<iframe style="width:120px;height:240px;" marginwidth="0" marginheight="0" scrolling="no" frameborder="0" src="//rcm-fe.amazon-adsystem.com/e/cm?lt1=_blank&bc1=000000&IS2=1&bg1=FFFFFF&fc1=000000&lc1=0000FF&t=twosquirrel-22&o=9&p=8&l=as4&m=amazon&f=ifr&ref=as_ss_li_til&asins=4524261583&linkId=2275e88771bd3b0493ba4eddb4c17520"></iframe>
+</html>
 ところが、データを追加したり、間違っていたところを１つでも訂正したりすると、統計処理を最初からやり直さなければいけません。
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 ようなシステムを構築できれば、理想的です。
+これは、R Markdownというシステムを用いることで可能となります。デメリットとしては、R言語の勉強が必要であること、日本語での利用には、文字化けなどにやや難があることですが、R Markdownをマスターしたあかつきには、きっと、統計処理を含むレポート作成がラクチンになることでしょう。（筆者は、まだ、全く、その域に達しておりません。）
+そして、R Markdownを利用するためのプラットフォームとして、R Studioという統合開発環境（IDE）、つまりコンピューターソフト上で、R Notebookファイルを作成していく方法が有用です。
+以下のサイトには、R Markdownの使用方法が分かりやすく記載されています。
+連載\\
+R Markdownで楽々レポートづくり\\
+http://gihyo.jp/admin/serial/01/r-markdown
-作成中
+このサイトでは、上記サイトの内容その他を、R Studioで実行する方法を記載させていただきたいと思います。
-プログラミンかグ言語Rを発展させて、クリック操作だけで統計解析を行うことができるようにしたフリーソフトです。Windowsパソコンであれば、インストールも簡単です。もちろんMacでも使用することができます。唯一の難点は、エクセルで集めたデータを、一度、csvファイルに変換してから、EZRに取り込むのが、多少、面倒なところです。2017年現在、筆者はこれを愛用しています。
+もちろん、初めて統計をしようとする人にとっては、『どのようなときに、どの手法を使えばよいのか？』というところが分からないものです。そのような方は、まずは、2015年に発売された[[http://amzn.to/2zVgALx|初心者でもすぐにできるフリー統計ソフトEZR(Easy R)で誰でも簡単統計解析]]を読んで、具体的な実例とともに、例えば、t検定を行ってよい条件や、実際のt検定のやり方、結果の解釈の仕方などを理解する必要があります。
+R Markdownは、統計についてはある程度理解した上で、Rプログラミングをやってみようと思う人、特に同じようなレポートを何回も書かなければならない人にお勧めです。
-<html>
+R Markdownを用いて論文を作成した場合は、論文のMethodには、
-<iframe style="width:120px;height:240px;" marginwidth="0" marginheight="0" scrolling="no" frameborder="0" src="//rcm-fe.amazon-adsystem.com/e/cm?lt1=_blank&bc1=000000&IS2=1&bg1=FFFFFF&fc1=000000&lc1=0000FF&t=twosquirrel-22&o=9&p=8&l=as4&m=amazon&f=ifr&ref=as_ss_li_til&asins=4524261583&linkId=2275e88771bd3b0493ba4eddb4c17520"></iframe>
+<code>
-</html>
+All statistical analyses were performed with R 2.13.0 (R Foundation for Statistical Computing, Vienna, Austria).
-初めて統計をしようとする人にとっては、『どのようなときに、どの手法を使えばよいのか？』というところが分からないものです。しかし、2015年に発売された[[http://amzn.to/2zVgALx|初心者でもすぐにできるフリー統計ソフトEZR(Easy R)で誰でも簡単統計解析]]には、具体的な実例とともに、例えば、t検定を行ってよい条件や、実際のt検定のやり方、結果の解釈の仕方などが簡潔に分かりやすく書かれており、多少値段は高めにも思えますが、統計の本の中で一番のお勧めです。
+</code>
-この本を一冊読めばそれで十分なのですが、それだとこのサイトに書くことがなくなってしまうので、よく使う項目だけでも、解説させて頂きたいと思います。
+と記載すればよいようです。
-ちなみに、論文のMethodには、
+===== 開発環境 =====
+Windows 8.1 Pro (64-bit)\\
-<code>
+あらかじめ、EZRがインストールされているものとします。\\
+(EZRがインストールされていれば、Rがインストールされています。)
-All statistical analyses were performed with EZR (Saitama Medical Center, Jichi Medical University, Saitama, Japan), a graphical user interface for R 2.13.0 (R Foundation for Statistical Computing, Vienna, Austria) [19]. More precisely, EZR is a modified version of R commander (version 1.6-3) designed to add statistical functions used frequently used in biostatistics.
+EZRをインストールしていない場合は、Rをインストールしてください。
-</code>
-と記載すればよいようです。
-引用文献としては、以下を記載すればよいそうです。
-<code>
-Bone Marrow Transplantation 2013: 48, 452–458
+===== WindowsにRStudioをインストール =====
-</code>
+以下のサイトからインストーラーをダウンロードしてインストールするだけです。
+https://www.rstudio.com/products/rstudio/download/
+{{:pasted:20171211-233645.png}}
+上記の"Download"をクリックすると、以下のような画面になるので、
+"Installers"の、"RStudio 1.1.383 - Windows Vista/7/8/10"をクリックして、インストーラーをダウンロード。
+{{:pasted:20171211-233821.png}}
+約86MBですので、ダウンロードに数十秒かかります。\\
+ダウンロードした、"RStudio-1.1.383.exe"をダブルクリックしてインストール。
+{{:pasted:20171211-234114.png}}
+{{:pasted:20171211-234129.png}}
+{{:pasted:20171211-234151.png}}
+{{:pasted:20171211-234224.png}}
+インストールが完了したら、Windowsのスタートボタンから、RStudioを起動します。
+{{:pasted:20171211-234439.png}}
+これで、R Studioのインストールは完了です。
+試しに、Console画面で、足し算などを行ってみます。
+"1+1"と入力してから、"Enter"ボタンを押したりすると、以下のように計算ができます。
+{{:pasted:20171212-000747.png}}
+インストールができたら、まずは、以下のスライドと、サイトを軽く読んでおくことをお勧めします。
+Rの導入とRStudio事始め(改訂版)\\
+Takashi Yamane\\
+Published on Nov 30, 2015\\
+https://www.slideshare.net/TakashiYamane1/rrstudio\\
+<html>
+<iframe src="//www.slideshare.net/slideshow/embed_code/key/IiQmrfLsLADFy" width="595" height="485" frameborder="0" marginwidth="0" marginheight="0" scrolling="no" style="border:1px solid #CCC; border-width:1px; margin-bottom:5px; max-width: 100%;" allowfullscreen> </iframe> <div style="margin-bottom:5px"> <strong> <a href="//www.slideshare.net/TakashiYamane1/rrstudio" title="Rの導入とRStudio事始め(改訂版)" target="_blank">Rの導入とRStudio事始め(改訂版)</a> </strong> from <strong><a href="https://www.slideshare.net/TakashiYamane1" target="_blank">Takashi Yamane</a></strong> </div>
+</html>
+http://plaza.umin.ac.jp/~takeshou/R/RStudio1st.html
+{{:pasted:20171211-235146.png}}
+こちらの動画も雰囲気をつかむのに非常にお勧めです。
+<html>
+<iframe width="560" height="315" src="https://www.youtube.com/embed/6b8pFctsBog" frameborder="0" gesture="media" allow="encrypted-media" allowfullscreen></iframe>
+</html>
 ===== 参考文献 =====
+-02-21 RStudioでRを直感的に使おう\\
+http://togotv.dbcls.jp/20140221.html
+Rの導入とRStudio事始め(改訂版) - SlideShare\\
+https://www.slideshare.net/TakashiYamane1/rrstudio
+Rの初歩\\
+https://oku.edu.mie-u.ac.jp/~okumura/stat/first.html
+連載\\
+R Markdownで楽々レポートづくり\\
+http://gihyo.jp/admin/serial/01/r-markdown
+@etet-etet
+年08月23日に更新
+RとRStudioのインストールからpsychの使い方、クラスター分析までやってみる\\
+https://qiita.com/etet-etet/items/92284541a445f24fed16
+dplyr入門\\
+http://www.jaysong.net/dplyr_intro/
+【日本語訳】生物医学研究文献の誰でも見つけられる20の統計学的誤り\\
+www.ronbun.jp/point/follow_jp.html