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特定の遺伝子のexon, intronを表示する方法

特定の遺伝子のexon, intronのゲノム上に表示する方法

Ensembl
mouse
で目的の遺伝子を探す。

スプライシングバリアントに注意して、目的のmRNAを選択。
画面左側の「exon」を押す。
exonだけなら、これをそのまま印刷すればOK.

intronの配列もほしい場合(tail check用のPCR primer設定の場合など)
ページ左下の「Configure this page」をクリック。

Configure Page画面の「Show full intronic sequence」のチェックボックスをONにする。

右上のチェックボタンをクリック。

すると、ゲノム上のexon, intronがすべて表示される。

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Posted by twosquirrel