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00.初めての医療統計rとezr:01.ezr_とr_のインストール


01.EZR(とR)のインストール

初めての医療統計RとEZRトップページ

Rを使用するためには、RとRStudioのインストールが必要です。開発環境は、Windows10とします。

通常、Rは、https://cran.r-project.org/ から、Download for Windowsをクリックしてダウンロードしてインストールします。

しかし、今回は、EZRをインストールすることにより、自動的にRもインストールします。

2020/4/24にR 4.0.0が発表され、何かと面倒なので、https://cran.r-project.org/ から、Rをインストールすることをお勧めします。

また、その後、https://rstudio.com/products/rstudio/download/#download から、RStudioをインストールするとよいと思います。

開発環境

Panasonic RCF-RZ6
Windows 10 Pro (1803)

EZRのインストール

自治医科大学附属さいたま医療センターのEZR公式ホームページから、Windows用インストーラ(EZRsetup.exe (274MB))をダウンロードします。
ダウンロードしたEZRsetup.exeをダブルクリックして、指示に従ってインストールします。
http://www.jichi.ac.jp/saitama-sct/SaitamaHP.files/download.html

2019年10月時点で、EZR Version 1.40 がインストールされます。

EZRを上記の方法でインストールすると、Rも自動的にインストールされます。

EZR(64-bit)の起動

EZRのインストールが完了したら、画面左下のWidowsボタンの右隣りの『検索ボタン〇』をクリック>“ezr”と入力>上の方にEZR(64-bit)が表示されるので、それをクリックすることにより起動できます。

また、インストール時にデスクトップにEZRのショートカットを作成した場合は、そのショートカットをダブルクリックすることにより、EZRを起動することができます。

EZRを起動すると、

  1. まず、Rの画面が開き、
  2. その数十秒後に、Rコマンダー(EZR)の画面

が開きます。我々が使用するのは、後から開かれるRコマンダー(EZR)の画面となります。

EZRの操作方法のリンク

以下に記載させて頂きますので、もしよろしければ御覧ください。(別サイトに移動します。)

初めての医療統計 目次

Excelでcsv出力

EZRでcsvファイルの読み込み

EZRでtableoneでTable1を作成

memo

dataの入力方法

  1. 1行目に、一番左から項目を羅列する。
  2. 1行目は空欄は作らない。
  3. 1行目の項目は半角英字で始まり、2文字目以降は半角英数字またはピリオドのみ。
  4. 2行目以降は、1行につき、1症例のデータを記載する。
  5. 2行目以降でデータが無いセルは『NA』と記載する。

https://to-kei.net/r-beginner/r-1/
Rでのベクトル・行列の作成と四則演算・要素の参照【第1回】
2017/05/30

https://heavywatal.github.io/rstats/dplyr.html
dplyr — 高速data.frame処理

https://qiita.com/matsuou1/items/e995da273e3108e2338e
matsuou1
2016年01月22日に更新
dplyrを使いこなす!基礎編

https://www.marketechlabo.com/r-var-type/#i-13
Rでデータの整形(列のデータ型確認、列の抽出、列名の変更、列の型変換)

列の型の変換 as.numeric()

dataEp$base0M <- as.numeric(dataEp$base0M)

https://a-habakiri.hateblo.jp/entry/2016/12/18/213416
2016-12-18
【R】factor型について(2)_因子型(factor)から数値型(numeric)に戻すと数値が変わる?

read.csv(...,stringsAsFactors=FALSE)

http://bcl.sci.yamaguchi-u.ac.jp/~jun/notebook/r/tidyverse/dplyr/
列や行の追加
同じ列幅や行数の2つのデータフレームを結合させるときにはbind_rows()やbind_cols()を使う。

https://manamina.valuesccg.com/articles/898
2020年08月12日 公開
R(7) プログラミング(11) 「マーケター」キャリア(27)

Rで複数のデータフレームを結合するJOIN関数の使い方とは。マーケターが1からRを勉強します【第6回】
Rで複数のデータフレームを結合するJOIN関数の使い方とは。マーケターが1からRを勉強します【第6回】

https://qiita.com/tomotagwork/items/24d1d11a12bb38aa9f35
@tomotagwork
が2019年11月02日に更新
インフラ屋さんのためのR言語: プログラミング編

リンク


00.初めての医療統計rとezr/01.ezr_とr_のインストール.txt · 最終更新: 2021/07/11 by adash333