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00.初めての医療統計rとezr:07.colaboratoryで箱ひげ図と蜂群図


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00.初めての医療統計rとezr:07.colaboratoryで箱ひげ図と蜂群図 [2019/10/19]
adash333 [自前データのアップロードとread_excel()によるエクセルデータのRへの取り込み]
00.初めての医療統計rとezr:07.colaboratoryで箱ひげ図と蜂群図 [2021/08/08] (現在)
adash333 [07.Google ColaboratoryでRで箱ひげ図と蜂群図(ほうぐんず)]
行 1: 行 1:
 ====== 07.Google ColaboratoryでRで箱ひげ図と蜂群図(ほうぐんず) ====== ====== 07.Google ColaboratoryでRで箱ひげ図と蜂群図(ほうぐんず) ======
- ---//2019/10/17 更新//+ ---//2021/08/08 更新// 
 +[[00.初めての医療統計rとezr:index.html|初めての医療統計RとEZRトップページ]] 
  
  
行 15: 行 17:
 ===== ソースコード ===== ===== ソースコード =====
  
 +
 +https://colab.research.google.com/drive/1Jv0eQ0g7K09FfQvUIN4U5ewEW5qphZLV?hl=ja
  
  
行 29: 行 33:
 <code> <code>
 tidyverse tidyverse
 +cowplot
 </code> </code>
  
行 80: 行 85:
  
 {{:00.初めての医療統計rとezr:pasted:20191019-065944.png|}} {{:00.初めての医療統計rとezr:pasted:20191019-065944.png|}}
- 
 {{:00.初めての医療統計rとezr:pasted:20191019-070028.png|}} {{:00.初めての医療統計rとezr:pasted:20191019-070028.png|}}
  
行 92: 行 96:
 library(readxl) library(readxl)
  
-# d に、book2.xlsxの1番目のsheetをtibbleデータとして代入する +# d に、book3.xlsxの1番目のsheetをtibbleデータとして代入する 
-d <- read_excel("book2.xlsx", sheet=1)+d <- read_excel("book3.xlsx", sheet=1)
  
-# d を表示する +# dの最初の数行を表示する 
-d+head(d
 +str(d)
 </code> </code>
  
-{{:00.初めての医療統計rとezr:pasted:20191013-214857.png}}+{{:00.初めての医療統計rとezr:pasted:20191019-070555.png}} 
 + 
 +上記のようにして、自前のエクセルデータをGoogle ColaboratoryのR上に取り込むことができました。 
 + 
 +===== geom_plot()関数を用いて箱ひげ図を描く ===== 
 + 
 +以下のように入力して、Shift+Enterで、groupごとの箱ひげ図を作成します。 
 + 
 +<code> 
 +# ggplotのgeom_bosplot()関数を用いて箱ひげ図を描く 
 + 
 +ggplot(d, aes(x = group, y = glucose)) + 
 +  geom_boxplot() + 
 +  theme_classic() 
 +</code> 
 + 
 +{{:00.初めての医療統計rとezr:pasted:20191019-075647.png}} 
 + 
 +これで、箱ひげ図を描くことができました。 
 + 
 +===== geom_dotplot()関数を用いてbeesworm蜂群図(ほうぐんず)を描く ===== 
 + 
 +以下のように入力して、Shift+Enterで、groupごとの蜂群図(ほうぐんず)を作成します。 
 + 
 +<code> 
 +# geom_dotplot()関数を用いてbeesworm 蜂群図(ほうぐんず)を描く 
 +# https://wikidocs.net/40935 
 + 
 +ggplot(d, aes(x = group, y = glucose)) + 
 +  geom_dotplot(binaxis = "y", stackdir = "center") + 
 +  theme_classic() 
 +</code> 
 + 
 +{{:00.初めての医療統計rとezr:pasted:20191019-080521.png}} 
 + 
 + 
 + 
 + 
  
  
行 209: 行 252:
 S.Konishi S.Konishi
 2019-01-18 2019-01-18
 +
 +===== Rで平均値と標準偏差のグラフのリンク =====
 +
 +https://www.biodr-goro.com/entry/2019/04/24/224904
 +ggplot2でお絵かき:プロット+平均値+標準偏差を示す
 +20200622
 +
 +
  
  
行 234: 行 285:
  
  
 +cowplot...
 +
 +===== ソースコード =====
 +
 +
 +https://colab.research.google.com/drive/1Jv0eQ0g7K09FfQvUIN4U5ewEW5qphZLV?hl=ja
  
  


00.初めての医療統計rとezr/07.colaboratoryで箱ひげ図と蜂群図.1571468604.txt.gz · 最終更新: 2019/10/19 by adash333