ggplot2で論文用の白黒折れ線グラフ

差分

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--- ggplot2で論文用の白黒折れ線グラフ [2018/08/12]
adash333 [エラーバーを片方だけにつける]
+++ ggplot2で論文用の白黒折れ線グラフ [2018/10/07] (現在)
@@ ライン 4: / ライン 4: @@
 基本的には、<wrap em>ggplot()+theme_set(theme_classic())</wrap>を用いるのですが、具体的な方法を記載させていただきたいと思います。
+===== 開発環境 =====
+https://rstudio.cloud/
+年8月現在、メールアドレスを登録するのみで、無料です。
+[[https://rstudio.cloud/|RStudio Cloud]]のconsole画面（画面左下）で、<wrap hi><wrap em>install.packages("tidyverse")</wrap></wrap>を入力して、tidyverseパッケージをインストールした状態とします。
+{{:pasted:20180813-231913.png}}
+インストール終了後の画面
+{{:pasted:20180813-232101.png}}
+参考：http://twosquirrel.mints.ne.jp/?p=26918
+===== Rmdファイルの新規作成と保存 =====
+File > New File > R Notebook　で、R Notebookファイルを新規作成。
+{{:pasted:20180813-232234.png}}
+{{:pasted:20180813-232303.png}}
+以下のようにR Notebookファイルが作成されるので、
 ===== 1.サマリー作成用の関数の定義 =====
@@ ライン 103: / ライン 129: @@
 横軸が数字であれば、as.numeric(key)-0.1のように指定する
-横軸が文字（00pre, 1month, 2month, 3monthなど）であれば、keyを0,1,2,3などに置き換えてから、as.numeric()で数値に変更しておく。
+横軸が文字（00pre, 1month, 2month, 3monthなど）であれば、
+keyを0,1,2,3などに置き換えてから（csvファイルを修正しておいてもよいかもしれません）、
+as.numeric()で数値に変更しておく。
 </code>
@@ ライン 137: / ライン 165: @@
 https://stackoverflow.com/questions/44194700/selecting-direction-of-multiple-error-bars-in-a-line-plot
+===== グラフのtitleを真ん中上に記載 =====
+<code>
+library(tidyverse)
+tg <- ToothGrowth
+tgc <- summarySE(tg, measurevar="len", groupvars=c("supp","dose"))
+ggplot(tgc, aes(x=dose, y=len, shape=supp)) +
+    theme_set(theme_classic()) +
+    ylim(0, 40) +
+    ggtitle("Figure 3") +
+    theme(plot.title = element_text(hjust = 0.5))
+</code>
+===== リンク =====
+https://heavywatal.github.io/rstats/ggplot2.html

ggplot2で論文用の白黒折れ線グラフ.1534038378.txt.gz · 最終更新: 2018/10/07 (外部編集)