ggplot2で論文用の白黒折れ線グラフ
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ggplot2で論文用の白黒折れ線グラフ [2018/08/12] adash333 [リンク（英語）] |
ggplot2で論文用の白黒折れ線グラフ [2018/10/07] (現在) |
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| ライン 4: | ライン 4: | ||
| 基本的には、<wrap em>ggplot()+theme_set(theme_classic())</wrap>を用いるのですが、具体的な方法を記載させていただきたいと思います。 | 基本的には、<wrap em>ggplot()+theme_set(theme_classic())</wrap>を用いるのですが、具体的な方法を記載させていただきたいと思います。 | ||
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| + | ===== 開発環境 ===== | ||
| + | https://rstudio.cloud/ | ||
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| + | 2018年8月現在、メールアドレスを登録するのみで、無料です。 | ||
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| + | [[https://rstudio.cloud/|RStudio Cloud]]のconsole画面（画面左下）で、<wrap hi><wrap em>install.packages("tidyverse")</wrap></wrap>を入力して、tidyverseパッケージをインストールした状態とします。 | ||
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| + | {{:pasted:20180813-231913.png}} | ||
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| + | インストール終了後の画面 | ||
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| + | {{:pasted:20180813-232101.png}} | ||
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| + | 参考：http://twosquirrel.mints.ne.jp/?p=26918 | ||
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| + | ===== Rmdファイルの新規作成と保存 ===== | ||
| + | File > New File > R Notebook で、R Notebookファイルを新規作成。 | ||
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| + | {{:pasted:20180813-232234.png}} | ||
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| + | {{:pasted:20180813-232303.png}} | ||
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| + | 以下のようにR Notebookファイルが作成されるので、 | ||
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| ===== 1.サマリー作成用の関数の定義 ===== | ===== 1.サマリー作成用の関数の定義 ===== | ||
| ライン 140: | ライン 166: | ||
| https://stackoverflow.com/questions/44194700/selecting-direction-of-multiple-error-bars-in-a-line-plot | https://stackoverflow.com/questions/44194700/selecting-direction-of-multiple-error-bars-in-a-line-plot | ||
| + | ===== グラフのtitleを真ん中上に記載 ===== | ||
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| + | <code> | ||
| + | library(tidyverse) | ||
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| + | tg <- ToothGrowth | ||
| + | tgc <- summarySE(tg, measurevar="len", groupvars=c("supp","dose")) | ||
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| + | ggplot(tgc, aes(x=dose, y=len, shape=supp)) + | ||
| + | theme_set(theme_classic()) + | ||
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| + | ylim(0, 40) + | ||
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| + | ggtitle("Figure 3") + | ||
| + | theme(plot.title = element_text(hjust = 0.5)) | ||
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| + | </code> | ||
| ===== リンク ===== | ===== リンク ===== | ||
ggplot2で論文用の白黒折れ線グラフ.1534046741.txt.gz · 最終更新: 2018/10/07 (外部編集)
