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rでt検定

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rでt検定 [2018/02/03]
adash333 [3.正規分布に従う2群の分散が等しいかどうかの判定”F検定(var.test()関数)”]
rでt検定 [2020/08/12] (現在)
adash333 [Rでt検定]
行 1: 行 1:
 ====== Rでt検定 ====== ====== Rでt検定 ======
 +[[初めての医療統計:index.html|初めての医療統計 目次]]
  
 独立した2群間の連続変数の平均値を比較する方法 独立した2群間の連続変数の平均値を比較する方法
行 40: 行 41:
  
 p>0.05であれば、2群の平均値に有意差無し。 p>0.05であれば、2群の平均値に有意差無し。
 +
 +<code>
 +DM_pre <- c(0.0002458, 0.0001889, 0.000129)
 +DM_1POD <- c(0.0001442, 0.00007158, 0.0001055)
 +group1 <- DM_pre
 +group2 <- DM_1POD
 +t.test(group1, group2, paired=F)
 +</code>
 +
 +R Studioでの実行結果(F検定は行っていない)
 +
 +{{:pasted:20180409-084509.png}}
 +
 +元データが表になっている場合
 +
 +<code R>
 +x1 <- data1
 +x2 <- data2
 +
 +group1 <- x1[, "HbA1c"]
 +group2 <- x2[, "HbA1c"]
 +
 +t.test(group1, group2, paired=F)
 +</code>
 +{{:pasted:20190622-061419.png}}
 +
 +
 +
 +
  
 ===== 5.Welch検定"t.test(group1, group2, var.equal=F, paired=F)" ===== ===== 5.Welch検定"t.test(group1, group2, var.equal=F, paired=F)" =====
行 49: 行 79:
 p>0.05であれば、2群の平均値に有意差無し。 p>0.05であれば、2群の平均値に有意差無し。
  
-===== 6.Mann-Whitney U検定"wilcox.test()関数"??? =====+===== 6.Mann-Whitney U検定 =====
  
  
 http://cse.naro.affrc.go.jp/takezawa/r-tips/r/65.html http://cse.naro.affrc.go.jp/takezawa/r-tips/r/65.html
  
-上記サイトでは、ウィルコクソンの順位和検定と、マン・ホイットニーの U 検定が同じであると記載されているが、本当かど未確認+上記サイトでは、ウィルコクソンの順位和検定と、マン・ホイットニーの U 検定が同じであると記載されている
 + 
 +Wilcoxon-Mann-Whitney検定(WMW検定)\\ 
 +https://oku.edu.mie-u.ac.jp/~okumura/stat/wmw.html 
 + 
 +Rによるウィルコクソンの順位和検定\\ 
 +http://data-science.gr.jp/implementation/ist_r_wilcoxon_rank_sum_test.html 
 + 
 +<code> 
 +ウィルコクソンの順位和検定は2群間に対応ない場合に使.この検定法パラメトリック検定でいうところのスチューデントのt検定とかウェルチのt検定に相当する. 
 +</code> 
 + 
 +上記サイトよりコードを引用 
 + 
 +<code> 
 +install.packages("exactRankTests", repos="http://cran.ism.ac.jp/"
 +library(exactRankTests) 
 + 
 +wilcox.exact(x=vx,y=vy,paired=F) 
 +</code>
 ===== memo ===== ===== memo =====
  
行 67: 行 116:
  
 ===== 参考リンク ===== ===== 参考リンク =====
- 
- 
- 
 Rによるウェルチのt検定\\ Rによるウェルチのt検定\\
-http://data-science.gr.jp/implementation/ist_r_welch_t_test.html+http://data-science.gr.jp/implementation/ist_r_welch_t_test.html\\ 
 +{{:pasted:20180217-000345.png}}
  
 ===== 参考文献 ===== ===== 参考文献 =====

rでt検定.1517665680.txt.gz · 最終更新: 2018/10/07 (外部編集)