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clustalw(似ている配列を並べてくれる)

http://clustalw.ddbj.nig.ac.jp/top-j.html

NCBIやEnsemblに登録されているcDNA配列は、ときどき古かったり、間違っていたりすることがある。

あと、スプライシングバリアントもあったりして、比較したいときには、このようなソフトを使うと配列が比較しやすい。

(1)FASTA形式(1行目に「>dystrophin」2行目以降に「ATG…」)で2つ以上の配列を入力して、「入力内容の送信」ボタンをクリック。

(2)次の画面になってしばらくしたら、「View Result」ボタンをクリック。

(3)自動で並べてくれる。

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Posted by twosquirrel