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--- 00.初めての医療統計rとezr:08.ggplot2でグラフの体裁を調整 [2019/10/21] – [ggplot2で白黒グラフ] adash333
+++ 00.初めての医療統計rとezr:08.ggplot2でグラフの体裁を調整 [2022/02/22] (現在) – [タイトルとx軸y軸] adash333
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 ====== 08.ggplot2でグラフの体裁を調整 ======
+[[00.初めての医療統計rとezr:index.html|初めての医療統計RとEZR]]
 前回の[[00.初めての医療統計rとezr:07.colaboratoryで箱ひげ図と蜂群図|07.Google ColaboratoryでRで箱ひげ図と蜂群図(ほうぐんず)]]
+===== ggplot2で論文用の白黒のグラフをかく =====
+[[https://i-doctor.sakura.ne.jp/dokuwiki/doku.php/ggplot2%E3%81%A7%E8%AB%96%E6%96%87%E7%94%A8%E3%81%AE%E7%99%BD%E9%BB%92%E6%8A%98%E3%82%8C%E7%B7%9A%E3%82%B0%E3%83%A9%E3%83%95|ggplot2で論文用の白黒折れ線グラフ]]
+===== エスキス =====
+[[https://dreamrs.github.io/esquisse/index.html|esquisseエスキス]]
+<code>
+# RStudioの場合は、Console画面で、以下を入力
+install.packages("esquisse")
+# remotes::install_github("dreamRs/esquisse")
+# esquisse::esquisser(iris)
+# Webブラウザで開きたい場合
+esquisse::esquisser(viewer = "browser")
+</code>
+{{:00.初めての医療統計rとezr:pasted:20200506-001548.png}}
+{{:00.初めての医療統計rとezr:pasted:20200506-001836.png}}
+csvファイルは、UTF-8でエンコードしておく必要がありそう。
+pptx出力する場合は、
+<code>
+Packages 'officer' and 'rvg' are required to use this functionality.
+</code>
+だそうです。
+<code>
+install.packages("officer")
+install.packages("rvg")
+</code>
+すれば、パワーポイントファイル（pptx）として出力することもできます。どちらも非常に便利。
+エスキスの使い方（英語）
+https://dreamrs.github.io/esquisse/articles/get-started.html
+https://qiita.com/taro_9674/items/55dc92d30ba569465ca9
+@taro_9674
+年07月25日に投稿
+【R言語】もうggplot2の操作も怖くない!esquisseパッケージの効力が絶大だった件
+https://note.com/tqwst408/n/n82d56c69a18e
+R言語:ggplotのGUIをまとめてみる
+Osamu_Machida
+/02/23 13:07
+https://www.marketechlabo.com/r-best-packages/
+Rのおすすめパッケージ2019年版
 ===== グラフ全体の大きさと解像度 =====
+背景を消す
+<code>
+g + theme(panel.grid.major = element_blank(),
+          panel.grid.minor = element_blank(),
+          panel.background = element_blank()
+    )
+</code>
 ===== タイトルとx軸y軸 =====
-タイトルがデフォルトだと左寄り。中央寄せにしたいときはthemeにelement_text(hjust = 0.5)を指定します。
+タイトルはデフォルトだと左寄り。中央寄せにしたいときはthemeにelement_text(hjust = 0.5)を指定します。
 <code>
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 </code>
+軸のタイトルとラベルの文字サイズを変える
+<code>
+g+theme(axis.text=element_text(size=12),
+        axis.title=element_text(size=14,face="bold"))
+</code>
+軸の表示範囲を設定
 <code>
 scale_x_continuous(breaks = seq(10, 100, by = 10))
 scale_x_log10(limit = c(0.1 , 10))
 scale_y_log10(breaks = c(1, 5, 10)* 1000)
+</code>
+x軸の表示の順番を変える（factorの場合）
+<code>
+scale_x_discrete(limit=c('virginica', 'setosa', 'versicolor'))
+</code>
+x軸の表示の値を変える（factorの場合）
+<code>
+scale_x_discrete("Cut Type", labels = c("Fair" = "F","Good" = "G", "Very Good" = "VG","Premium" = "P","Ideal" = "I"))
+</code>
+値を変えて、同時に順序も変える（factor）
+<code>
+ggplot(summary_d, aes(x = time, y = temp_mean, group = 1)) +
+  geom_line() +
+  geom_point() +
+  scale_x_discrete(
+    limit = c("before", "a0sec","a30sec","a60sec","a180sec"),
+    breaks = c("before", "a0sec","a30sec","a60sec","a180sec"),
+    labels = c("before", "0sec","30sec","60sec","180sec")
+  ) +
+  scale_shape_manual(values=c(1,15)) +
+  scale_y_continuous(limits = c(20, 30)) +
+  geom_errorbar(aes(ymax = temp_mean + temp_sd, ymin = temp_mean - temp_sd), width = 0.1) +
+  theme_classic()
 </code>
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 年9月8日月曜日
 ggplot2で作図４：デザイン
+https://qiita.com/yuifu/items/83103d03aef2dba95465
+@yuifu
+年03月10日に投稿
+ggplot2で論文用の図を作るときに使いたいオプション（点のshape、色、軸の文字の大きさ、色、エラーバー、背景）
+http://mukkujohn.hatenablog.com/entry/2016/10/08/155023
+-10-08
+ggplot2を使って、軸を制御する-2
+http://mukkujohn.hatenablog.com/entry/2016/10/24/232525
+-10-24
+ggplot2を使って、軸を制御する-4