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00.初めての医療統計rとezr:04.googlecolaboratoryでrプログラミング


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00.初めての医療統計rとezr:04.googlecolaboratoryでrプログラミング [2019/10/13] – [GoogleColaboratoryでRプログラミングを行うようにする方法の大まかな流れ] adash33300.初めての医療統計rとezr:04.googlecolaboratoryでrプログラミング [2022/03/23] (現在) – [流れ] adash333
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 ====== 04.GoogleColaboratoryでRプログラミング ====== ====== 04.GoogleColaboratoryでRプログラミング ======
  ---//2019/10/10 更新//  ---//2019/10/10 更新//
 +[[00.初めての医療統計rとezr:index.html|初めての医療統計RとEZRトップページ]]
 +
 +
 前回は、[[00.初めての医療統計rとezr:03.excelでcsv出力|03.Excelでcsv形式でデータを保存]]で、Rで自作データを読み込むための準備を行いました。 前回は、[[00.初めての医療統計rとezr:03.excelでcsv出力|03.Excelでcsv形式でデータを保存]]で、Rで自作データを読み込むための準備を行いました。
  
 今回は、[[https://colab.research.google.com/|GoogleColaboratory]]を用いて、オンライン上でRプログラミングを行い、[[[[00.初めての医療統計rとezr:03.excelでcsv出力|03.Excelでcsv形式でデータを保存]]のcsvデータを読み込んで、平均値や最大値などを計算してみたいと思います。 今回は、[[https://colab.research.google.com/|GoogleColaboratory]]を用いて、オンライン上でRプログラミングを行い、[[[[00.初めての医療統計rとezr:03.excelでcsv出力|03.Excelでcsv形式でデータを保存]]のcsvデータを読み込んで、平均値や最大値などを計算してみたいと思います。
  
 +===== 流れ =====
 +
 +(1)https://colab.research.google.com/drive/17wdl8HaRrjCQpdRC3Sg9KAqH2DQNLryr
 +を、名前をつけて保存。(Rが使用できる設定になっている。)
 +
 +(2)Rでプログラミング(tidyverseはあらかじめ入っている)
 +
 +(3)以下のサイトで、Googleドライブ経由でipynbファイルをhtmlファイルに変換(googleログインが必要)
 +https://htmtopdf.herokuapp.com/ipynbviewer/
 +
 +===== 参考:tibbleとtribble =====
 +# tibble, tribbleについては以下のページを参考に
 +# https://opur.club/textbook/2018-2-2/#tibble
 +
 +<code>
 +library(tidyverse)
 +d <- tribble(
 +  ~ID,~age,~sex,~DM,~HbA1c00M,~HbA1c01M,~HbA1c02M,~HbA1c03M,
 +  1,56,"M",1,7.3,7.4,7.3,7.4,
 +  2,77,"F",1,8.3,8.4,8.3,8.2,
 +  3,68,"M",1,7.1,7,7,7,
 +  4,81,"F",1,7.6,7.4,7.3,7.4,
 +  5,42,"M",1,10.1,8.4,7.3,6.5,
 +  6,65,"M",1,6.1,6.2,6.2,6.3,
 +  7,68,"F",1,7.8,7.4,7.9,8.4
 +)
 +d
 +</code>
 +csvファイルの読み込み
 +<code>
 +# データの取り込み
 +library(tidyverse)
 +d <- read_csv("book2.csv"
 +d
 +</code>
 ===== ソースコード ===== ===== ソースコード =====
  
行 14: 行 52:
  
 ===== GoogleColaboratoryでRプログラミングを行うようにする方法の大まかな流れ ===== ===== GoogleColaboratoryでRプログラミングを行うようにする方法の大まかな流れ =====
-<方法1> +<方法1> ← 最もお勧めです 
-以下のテンプレートをダウンロードしたのち、Google Colaboratory上にアップードして、編集すると、そのままRを利用することができます。+以下のテンプレートへ行き、Googleログインして、『ファイル』>『ドライブにコピーを保存』を順にクリックすると、自分のipynbファイルとして、そのままRを利用することができます。
  
 https://colab.research.google.com/drive/1Wbt_tHd9KFEEszzXchwuFrhyCNR_KgtC https://colab.research.google.com/drive/1Wbt_tHd9KFEEszzXchwuFrhyCNR_KgtC
  
- +{{:00.初めての医療統計rとezr:pasted:20191013-165744.png}}
- +
  
 <方法2> <方法2>


00.初めての医療統計rとezr/04.googlecolaboratoryでrプログラミング.1570985592.txt.gz · 最終更新: 2019/10/13 by adash333

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