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00.初めての医療統計rとezr:06.colaboratoryでrで折れ線グラフ


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00.初めての医療統計rとezr:06.colaboratoryでrで折れ線グラフ [2020/05/05] – [ggplot2 memo] adash33300.初めての医療統計rとezr:06.colaboratoryでrで折れ線グラフ [2021/08/09] (現在) – [Rで折れ線グラフ 過去のリンク] adash333
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 今回は、自作データのうち、『時系列データ』をアップロードして、グラフを描画し、対応のあるt検定を行ってみたいと思います。 今回は、自作データのうち、『時系列データ』をアップロードして、グラフを描画し、対応のあるt検定を行ってみたいと思います。
 +
 +===== Rで折れ線グラフ 過去のリンク =====
 +https://i-doctor.sakura.ne.jp/font/?p=44413
 +<wrap hi>dplyr(tidyverse)でsummarise()関数で標準偏差sdを計算するとNAになってしまうときは平均meanの名前の付け方に注意</wrap>
 +2020年8月15日
 +
 +[[https://i-doctor.sakura.ne.jp/dokuwiki/doku.php/ggplot2%E3%81%A7%E8%AB%96%E6%96%87%E7%94%A8%E3%81%AE%E7%99%BD%E9%BB%92%E6%8A%98%E3%82%8C%E7%B7%9A%E3%82%B0%E3%83%A9%E3%83%95|ggplot2で論文用の白黒折れ線グラフ]]
 +
 +
 +https://i-doctor.sakura.ne.jp/font/?p=21579
 +ggplot2で折れ線グラフ(1)
 +2017年12月12日
 +
 +https://i-doctor.sakura.ne.jp/font/?p=21594
 +ggplot2で折れ線グラフ(2)
 +2017年12月12日
 +
 +ggplot2で折れ線グラフ(factorでもgroup=1で折れ線グラフを描ける)
 +https://gist.github.com/adash333/0f3f92e0d1676d27a5985c57a0eff1e6
 +
 +
  
 ===== ソースコード ===== ===== ソースコード =====
-ソースコード1:191014_ggplot-line-chart_001.ipynb +(1)単一の折れ線グラフ 
-https://colab.research.google.com/drive/1upLvY2bG2pnORT1NeVGA0S-d01Gj6bkP+https://colab.research.google.com/drive/1LH8RInDrx0XDS3tivf8coUHaEjG9z15t 
 + 
 +https://gist.github.com/adash333/6ebcbb98ebc064ff94c8475d7833bd98 
 + 
 +(2)200726_ggplot-line-chart_001.ipynb 
 +https://colab.research.google.com/drive/1SZTh9i62LHZ9qShJKi6CjX3qnMAwZ1qU
  
-https://adash333.github.io/ggplot2-example/191014_ggplot-line-chart_001.html+https://gist.github.com/adash333/af401dc1aca27c9dad9a37ccfd076beb
  
-ソースコード2+(3)
 https://colab.research.google.com/drive/1hsdpM_FlUAIK8KzZJDUaUetrRnEons3U?hl=ja https://colab.research.google.com/drive/1hsdpM_FlUAIK8KzZJDUaUetrRnEons3U?hl=ja
 (Colaboratoryでは、なぜか、packageのインストールがうまくいかない。また、stat_summary関数の一部がうまく動かない) (Colaboratoryでは、なぜか、packageのインストールがうまくいかない。また、stat_summary関数の一部がうまく動かない)
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 https://adash333.github.io/ggplot2-example/191016_ggplot-bar.html https://adash333.github.io/ggplot2-example/191016_ggplot-bar.html
  
 +4
  
 +https://gist.github.com/adash333/fd7e673debefa7547895f05d3b50c04f
  
  
行 148: 行 176:
 </code> </code>
  
 +2021年現在、pivot_longer()関数が推奨です。
 +
 +https://qiita.com/yanami/items/3775df6c579fd0a2d60c
 +@yanami
 +が2020年09月15日に更新
 +【tidyr】gather?, spread? もう古い。時代はpivot
 ==== mutate()関数について ==== ==== mutate()関数について ====
 列を追加するときには、mutate()関数を用いるのが便利です。 列を追加するときには、mutate()関数を用いるのが便利です。
行 331: 行 365:
 [[http://i-doctor.sakura.ne.jp/dokuwiki/doku.php/ggplot2でタイトルとx軸y軸の設定|ggplot2でタイトルとx軸y軸の設定]] [[http://i-doctor.sakura.ne.jp/dokuwiki/doku.php/ggplot2でタイトルとx軸y軸の設定|ggplot2でタイトルとx軸y軸の設定]]
  
 +
 +http://www.sthda.com/english/wiki/ggplot2-error-bars-quick-start-guide-r-software-and-data-visualization
 + ggplot2 error bars : Quick start guide - R software and data visualization
  
 https://www.slideshare.net/nocchi_airport/ggplot2-62471507 https://www.slideshare.net/nocchi_airport/ggplot2-62471507
行 458: 行 495:
  
 ===== ggplot2 memo ===== ===== ggplot2 memo =====
 +
 +[[https://dreamrs.github.io/esquisse/index.html|esquisseエスキス]]で描いてからコードをコピペする?
 +
  
 グラフ作成テンプレート グラフ作成テンプレート
行 472: 行 512:
   -表示範囲、軸のタイトルを設定   -表示範囲、軸のタイトルを設定
   -最終的な微調整   -最終的な微調整
-  -ggsave()関数で画像を出力+  -[[https://mickey24.hatenablog.com/entry/20110316/ggplot2_ggsave|ggsave()関数で画像を出力]]
  
 参考:[[https://mrunadon.github.io/ThesisPlot/|論文用の棒グラフと折れ線グラフをggplot2で描く]] 参考:[[https://mrunadon.github.io/ThesisPlot/|論文用の棒グラフと折れ線グラフをggplot2で描く]]
行 495: 行 535:
 2016年06月10日に更新 2016年06月10日に更新
 ggplot2に関する資料まとめ ggplot2に関する資料まとめ
 +
 +===== エスキス =====
 +[[https://dreamrs.github.io/esquisse/index.html|esquisseエスキス]]
 +
 +<code>
 +install.packages("esquisse")
 +# remotes::install_github("dreamRs/esquisse")
 +
 +esquisse::esquisser(iris)
 +
 +# Webブラウザで開きたい場合
 +esquisser(viewer = "browser")
 +</code>
 +
 +
 +エスキスの使い方(英語)
 +https://dreamrs.github.io/esquisse/articles/get-started.html
 +
 +
 +
 +https://qiita.com/taro_9674/items/55dc92d30ba569465ca9
 +@taro_9674
 +2019年07月25日に投稿
 +【R言語】もうggplot2の操作も怖くない!esquisseパッケージの効力が絶大だった件
 +
 +https://note.com/tqwst408/n/n82d56c69a18e
 +R言語:ggplotのGUIをまとめてみる
 +Osamu_Machida
 +2019/02/23 13:07
 +
 +https://www.marketechlabo.com/r-best-packages/
 +Rのおすすめパッケージ2019年版
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00.初めての医療統計rとezr/06.colaboratoryでrで折れ線グラフ.1588674743.txt.gz · 最終更新: 2020/05/05 by adash333

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