00.初めての医療統計rとezr:07.colaboratoryで箱ひげ図と蜂群図
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00.初めての医療統計rとezr:07.colaboratoryで箱ひげ図と蜂群図 [2019/10/18] – [論文用の白黒の図の作成とtheme_classic()] adash333 | 00.初めての医療統計rとezr:07.colaboratoryで箱ひげ図と蜂群図 [2020/07/24] – [Rでbeesworm蜂群図(ほうぐんず)のリンク] adash333 | ||
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===== ソースコード ===== | ===== ソースコード ===== | ||
+ | |||
+ | https:// | ||
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< | < | ||
tidyverse | tidyverse | ||
+ | cowplot | ||
</ | </ | ||
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今回は、191018_ggplot-boxplot-beesworm_001.ipynb という名前にしました。 | 今回は、191018_ggplot-boxplot-beesworm_001.ipynb という名前にしました。 | ||
- | {{: | + | {{: |
+ | |||
+ | ===== 自前データのアップロードとread_excel()によるエクセルデータのRへの取り込み ===== | ||
+ | 今回、Rに取り込みたい自前データ{{ : | ||
+ | |||
+ | 画面左上の『>』をクリックして、左側からタブのような画面を引き出します。 | ||
+ | |||
+ | {{: | ||
+ | |||
+ | 『ファイル』をクリック。 | ||
+ | |||
+ | {{: | ||
+ | |||
+ | 『アップロード』をクリック。 | ||
+ | |||
+ | {{: | ||
+ | |||
+ | book3.xlsx を選択して、『開く』をクリック。 | ||
+ | |||
+ | {{: | ||
+ | {{: | ||
+ | |||
+ | 左側の画面に、book3.xlsxが表示されるので、右側のコードを入力する画面に以下を入力して、Shift+Enterを押して実行します。 | ||
+ | |||
+ | < | ||
+ | # 後で使用するので、とりあえずtidyverseを使用するための準備 | ||
+ | library(tidyverse) | ||
+ | |||
+ | # read_excel()関数を使用するための準備 | ||
+ | library(readxl) | ||
+ | |||
+ | # d に、book3.xlsxの1番目のsheetをtibbleデータとして代入する | ||
+ | d <- read_excel(" | ||
+ | |||
+ | # dの最初の数行を表示する | ||
+ | head(d) | ||
+ | str(d) | ||
+ | </ | ||
+ | |||
+ | {{: | ||
+ | |||
+ | 上記のようにして、自前のエクセルデータをGoogle ColaboratoryのR上に取り込むことができました。 | ||
+ | |||
+ | ===== geom_plot()関数を用いて箱ひげ図を描く ===== | ||
+ | |||
+ | 以下のように入力して、Shift+Enterで、groupごとの箱ひげ図を作成します。 | ||
+ | |||
+ | < | ||
+ | # ggplotのgeom_bosplot()関数を用いて箱ひげ図を描く | ||
+ | |||
+ | ggplot(d, aes(x = group, y = glucose)) + | ||
+ | geom_boxplot() + | ||
+ | theme_classic() | ||
+ | </ | ||
+ | |||
+ | {{: | ||
+ | |||
+ | これで、箱ひげ図を描くことができました。 | ||
+ | |||
+ | ===== geom_dotplot()関数を用いてbeesworm蜂群図(ほうぐんず)を描く ===== | ||
+ | |||
+ | 以下のように入力して、Shift+Enterで、groupごとの蜂群図(ほうぐんず)を作成します。 | ||
+ | |||
+ | < | ||
+ | # geom_dotplot()関数を用いてbeesworm 蜂群図(ほうぐんず)を描く | ||
+ | # https:// | ||
+ | |||
+ | ggplot(d, aes(x = group, y = glucose)) + | ||
+ | geom_dotplot(binaxis = " | ||
+ | theme_classic() | ||
+ | </ | ||
+ | |||
+ | {{: | ||
+ | |||
+ | |||
+ | |||
+ | |||
+ | |||
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2018-08-03 | 2018-08-03 | ||
Rmarkdownで蜂群図(ほうぐんず)を書いてみよう! | Rmarkdownで蜂群図(ほうぐんず)を書いてみよう! | ||
+ | |||
+ | https:// | ||
+ | ggplot2を用いてグラフ作成 | ||
+ | S.Konishi | ||
+ | 2019-01-18 | ||
+ | |||
+ | ===== Rで平均値と標準偏差のグラフのリンク ===== | ||
+ | |||
+ | https:// | ||
+ | |||
+ | |||
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===== 論文用の白黒の図の作成とtheme_classic() ===== | ===== 論文用の白黒の図の作成とtheme_classic() ===== | ||
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+ | cowplot... | ||
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+ | ===== ソースコード ===== | ||
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+ | https:// | ||
00.初めての医療統計rとezr/07.colaboratoryで箱ひげ図と蜂群図.txt · 最終更新: 2021/08/08 by adash333