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00.初めての医療統計rとezr:14.rでone-wayanova


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00.初めての医療統計rとezr:14.rでone-wayanova [2021/06/14] – [等分散性がない場合または気にしない場合はWelch Test(Welchの分散分析)] adash33300.初めての医療統計rとezr:14.rでone-wayanova [2021/06/14] (現在) – [one-way ANOVAリンク] adash333
行 70: 行 70:
 (引用ここまで) (引用ここまで)
  
-===== 等分散性がない場合または気にしない場合はWelch Test(Welchの分散分析) =====+http://stack.sakura.ne.jp/stat/index.php?%E7%90%83%E9%9D%A2%E6%80%A7 
 +球面性 sphericity 
 + 
 +> 3回以上繰り返しのある分散分析を行うには、球面性の仮定が保たれてないといけない。 
 + 
 + 
 + 
 + 
 +===== 等分散性がない場合または気にしない場合はWelch Test(Welchの分散分析) Welch ANOVA ===== 
 + 
 +https://www.statology.org/welchs-anova-in-r/ 
 + APRIL 12, 2021 BY ZACH 
 +How to Perform Welch’s ANOVA in R (Step-by-Step) 
 + 
 +https://www.reddit.com/r/statistics/comments/ay7zsf/welchs_anova_post_hoc_in_r/ 
 +Posted byu/Half_Flatworm 
 +2 years ago 
 +Welch's ANOVA post hoc in R 
 +→ R 4.0.0では、install.packages("biostat") ができず。
  
 https://stackoverflow.com/questions/28587498/post-hoc-tests-for-one-way-anova-with-welchs-correction-in-r https://stackoverflow.com/questions/28587498/post-hoc-tests-for-one-way-anova-with-welchs-correction-in-r
 Post-hoc tests for one-way ANOVA with Welch's correction in R Post-hoc tests for one-way ANOVA with Welch's correction in R
 Asked 6 years, 3 months ago Asked 6 years, 3 months ago
-Active 5 years, 11 months ago 
-Viewed 10k times 
  
 +
 +https://rdrr.io/github/GegznaV/BioStat/man/posthoc_anova.html
 +posthoc_anova: *!!* Post-hoc tests for ANOVA and Welch ANOVA
  
  
行 106: 行 125:
  
  
 +===== Welch ANOVAでpost hoc test =====
 +Welch ANOVAを用いる(oneway.test(y ~ group, data=data, var.equal=FALSE))のは、『正規分布』であるが、『等分散ではない』とき。(等分散でも用いてもよい。ぶっちゃけ、等分散は調べないで、最初からone way ANOVAではなく、Welch ANOVAで計算する方法もあり。)
 +
 +https://statisticsbyjim.com/anova/welchs-anova-compared-to-classic-one-way-anova/
 +Benefits of Welch’s ANOVA Compared to the Classic One-Way ANOVA
 +By Jim Frost 
 +
 +> The Games-Howell post hoc test, like Welch’s analysis of variance, does not require the groups to have equal standard deviations. Conversely, Tukey’s method does require equal standard deviations.
 +
 +
 +
 +http://www.f.kpu-m.ac.jp/y/math/Med_Stat/files/stat4h.pdf
 +の、スライドp25
 +(引用ここから)
 +{{:00.初めての医療統計rとezr:pasted:20210614-150612.png}}
 +(引用ここまで)
  
 +http://aoki2.si.gunma-u.ac.jp/R/oneway-ANOVA.html
 +一元配置分散分析と多重比較     Last modified: Apr 09, 2015
  
 +<code>
 +# インストールは,以下の 1 行をコピーし,R コンソールにペーストする
 +source("http://aoki2.si.gunma-u.ac.jp/R/src/tukey.R", encoding="euc-jp")
 +</code>
  
  
 +関数のインストールが必要。
 +<code>
 +source("http://aoki2.si.gunma-u.ac.jp/R/src/tukey.R", encoding="euc-jp")
 +</code>
 +使用例
 +<code>
 +x <- c(
 +  205, 206, 164, 190, 194, 203,
 +  201, 221, 197, 185,
 +  248, 265, 197, 220, 212, 281,
 +  202, 276, 237, 254, 230
 +  )
 +g <- rep(paste("A", 1:4, sep=""), c(6, 4, 6, 5))
 +data <- list(x,g)
 +oneway.test(x~g, data=data, var.equal=FALSE)
 +</code>
 +{{:00.初めての医療統計rとezr:pasted:20210614-153017.png}}
  
 +p<0.05 なので、Welch ANOVAで4群の平均値に有意差あり。
 +→ Games-Howellで、post hoc Testを行う。
 +<code>
 +# tukey()関数を用いるためには、source("http://aoki2.si.gunma-u.ac.jp/R/src/tukey.R", encoding="euc-jp") が必要
 +tukey(x, g, method="Games-Howell")
 +</code>
 +{{:00.初めての医療統計rとezr:pasted:20210614-153329.png}}
 +→ しかし、今回は、全ての組み合わせのp > 0.05 なので、どの2群にも有意差は無し。
  
  


00.初めての医療統計rとezr/14.rでone-wayanova.1623653249.txt.gz · 最終更新: 2021/06/14 by adash333

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