RStudioでRMarkdown（１）
RStudioをググっていた時にたまたま見つけたページ
R Markdownで楽々レポートづくり
第1回 レポートづくりのオートメーション化 ～素早く・ミスなく・再現可能に～
2015年5月8日
高橋康介
http://gihyo.jp/admin/serial/01/r-markdown/0001
これをやってみたい！というか、可能ならば、普段から使用してみたい！
RMarkdownというものを使うと、レポート作成をオートメーション化できるらしい。
何らかの実験データなどの統計をとり、それをレポートにする場合、実験データが増えたり、減ったり、差し替えられたとき、今までは、統計を最初からすべてやり直し、その結果をワードファイルにコピペするという作業を行っていた。
RMarkdownをうまく使用すれば、
「レポートの文書を作成・編集しながら，図・表・数値を埋め込みたい場所に，その分析を行うコードを記述しておき、元データが書き換えられたら、自動的に（？）再度、統計の計算が行われて、統計の結果が自動的にレポート内で更新される」
らしい。（そんなうまいことってあるのか？バージョン管理は？（→もしかして、こここでgitの登場か？））
（環境）
Windows8.1
R version 3.2.2(2015-08-14)
R Studio 0.99.903
（０）参考動画
（１）RMarkdownのインストール
File > New File > R Markdown
うわっ、文字化けしてる。。。
何も起こらない、、、RStudioを再起動
うまくいかない、、、なぜだ、、、
第2回 レポートづくりを加速せよ ～R Markdown環境の導入＆チュートリアル～
リスト
2015年5月22日 高橋康介
http://gihyo.jp/admin/serial/01/r-markdown/0002
RStudio上で、パッケージをインストールできない 18th November 2013
http://banker0507.blogspot.jp/2013/11/rstudio.html
RGUI（64bit）を起動して、RMarkdownのインストールを試みる。
install.packages("rmarkdown", dependencies = TRUE)
pandocのインストール
https://github.com/jgm/pandoc/releases/tag/1.18
のページの一番下の Downloads から、pandoc-1.18-windows.msi をダウンロードしてインストール。
RGui（64-bit）を再起動
library(rmarkdown) pandoc_available()
なんか警告メッセージが出るが、いけそうかな？
RStudioを再起動
File > New File > R Markdown
おおっ！
Ctrl + S で保存。文字コードは、とりあえず、UTF-8 にしておく。
画面の上の方の、Knit HTML をクリックすると、何やら計算されて、、、
html ファイルしか入っていない！図などは、その都度、Rで計算されて表示されているということか、、、
htmlファイルをブラウザで開き、PDFで保存すると、以下のようなPDFファイルに。
RMarkdownから直接PDFを出力することもできるそう。（なんか追加でインストールが必要らしい）
なんと、ワードファイルが簡単に出力できる。
Knit HTML の右横の三角ボタンをクリックして、Knit Wordにすると、Wordファイルが作成される！この中のグラフならコピペできる！感動！
RStudioでのRMarkdownは、環境構築がやや難しかった（Rstudioからではなく、RGui(64-bit)から、packageをインストールする必要があった）が、なんとかHello Worldできた。
これから、可能であれば使ってみたい。
っていうか、ここまでくると、RStudio Serverを使ってみたくなってしまう。
R による分析環境構築 (RStudio Server)
Salingerが2015/04/11に投稿
http://qiita.com/Salinger/items/450506ede57707ab1f55
Openshiftではできないかなあ。。。
（参考）
【まとめ】RMarkdown2で何が変わったのか？
uriが2014/06/21にKobitoから投稿(2015/06/02に編集)http://qiita.com/uri/items/0c3b3f918f79b3e3e6d4
2014年版RStudioを使った文書作成法
uriが2014/12/14に投稿
http://qiita.com/uri/items/5cce4431ad0d96b96689
RStudioから使えるR Markdownで日本語のPDFを作成する 2014-10-15
http://bicycle1885.hatenablog.com/entry/2014/10/15/032024
