ImageJで手動でセルカウントするときは”Cell Counter”プラグインが便利

2019年9月15日2019年9月16日

ImageJは便利そうなプラグインがいろいろありますが、環境構築するより前に、手動で数えた場合が早い場合が多々あります。

画像の中の特定の細胞の数などを手動でカウントしたい場合は、メニューバーの、

Plugins > Analyze > Cell Counter > Cell Counter

から、Cell Counterプラグインを出します。

その後の手順は以下のようになります。

カウントしたい画像を開く
Cell Counter内で、Keep OriginalのチェックボックスをONにする
Initialize　をクリック
左側のCountersのところのType1のラジオボタンをONにした状態で、画像内のカウントしたいものをクリックしていく。すると、自動的にカウントされていきます。
同じ画像内の別の種類の細胞をカウントしたいときは、 CountersのところのType2のラジオボタンをONにした状態で、画像内のカウントしたいものをクリックしていきます。
初回はなんかうまくいかないことがありますが、一度プラグインを消して、再度Cell Counterプラグインを出したりすると、私の場合はうまくいきました。