差分

このページの2つのバージョン間の差分を表示します。

--- 00.初めての医療統計rとezr:02.rstudioのインストール [2019/10/06] – [RStudioの使い方に関するリンク（1）] adash333
+++ 00.初めての医療統計rとezr:02.rstudioのインストール [2021/06/14] (現在) – [R Studioとは？] adash333
@@ 行 1: / 行 1: @@
 ====== 02.RStudioのインストール ======
+ ---//2019/10/08 更新//
 前回の[[00.初めての医療統計rとezr:01.ezr_とr_のインストール|01.EZR（とR）のインストール]]では、WindowsパソコンにEZRをインストールしました。今回は、R Studioをインストールします。
@@ 行 52: / 行 53: @@
 と記載すればよいようです。
+===== RStudioでRNotebookを保存する場所はC:/r/直下でフォルダ名などは英語のみで =====
+結論：C:/r/qpcr/210614_WelchTestPosthoc.Rmd　などのように、C:/からフォルダ名、ファイル名まで、全て半角英数字にする。
+特にフォルダ名に日本語などは入れないように気を付ける
+Previewしようとすると、以下のようなエラーが出て、グラフなどがうまく表示されないことがあります。
+<code>
+error creating notebook file name conversion problem --name too long?
+</code>
+{{:00.初めての医療統計rとezr:pasted:20210614-083241.png}}
+参考：https://stackoverflow.com/questions/52208134/issue-loading-data-of-file-name-conversion-problem-name-too-long
 ===== 開発環境 =====
 Windows 10 Pro (1803)
@@ 行 78: / 行 90: @@
 [[http://i-doctor.sakura.ne.jp/dokuwiki/doku.php/%E5%88%9D%E3%82%81%E3%81%A6%E3%81%AE%E5%8C%BB%E7%99%82%E7%B5%B1%E8%A8%88/index.html|初めての医療統計 目次]]
+  -[[http://i-doctor.sakura.ne.jp/dokuwiki/doku.php/rstudiocloud%E3%81%A7%E3%81%A9%E3%81%93%E3%81%A7%E3%82%82rstudio|RStudioCloudでどこでもRStudio]]
+  -[[http://i-doctor.sakura.ne.jp/dokuwiki/doku.php/windows%E3%81%ABrstudio%E3%82%92%E3%82%A4%E3%83%B3%E3%82%B9%E3%83%88%E3%83%BC%E3%83%AB|WindowsにRStudioをインストール]]
+  -[[http://i-doctor.sakura.ne.jp/dokuwiki/doku.php/rstudio%E3%81%A7%E6%96%B0%E8%A6%8F%E3%83%97%E3%83%AD%E3%82%B8%E3%82%A7%E3%82%AF%E3%83%88%E4%BD%9C%E6%88%90|RStudioで新規プロジェクト作成]]
+  -[[http://i-doctor.sakura.ne.jp/dokuwiki/doku.php/rstudio%E3%81%A7%E6%96%B0%E8%A6%8Frnotebook%E4%BD%9C%E6%88%90|RStudioで新規RNotebook作成]]
+  -[[http://i-doctor.sakura.ne.jp/dokuwiki/doku.php/rnotebook%E3%81%A7r%E3%82%A4%E3%83%B3%E3%83%A9%E3%82%A4%E3%83%B3%E3%82%B3%E3%83%BC%E3%83%89|RNotebookでRインラインコード]]
+  -[[http://i-doctor.sakura.ne.jp/dokuwiki/doku.php/excel%E3%81%A7csv%E5%87%BA%E5%8A%9B|Excelでcsv出力]]
+  -[[http://i-doctor.sakura.ne.jp/dokuwiki/doku.php/rnotebook%E3%81%A7csv%E3%83%95%E3%82%A1%E3%82%A4%E3%83%AB%E3%81%AE%E8%AA%AD%E3%81%BF%E8%BE%BC%E3%81%BF%E3%81%A8%E8%A1%A8%E7%A4%BA|RNotebookでcsvファイルの読み込みと表示]]
+  -[[http://i-doctor.sakura.ne.jp/dokuwiki/doku.php/rnotebook%E3%81%A7%E6%8A%98%E3%82%8C%E7%B7%9A%E3%82%B0%E3%83%A9%E3%83%95|RNotebookで折れ線グラフ]]
+  -[[http://i-doctor.sakura.ne.jp/dokuwiki/doku.php/ggplot2%E3%81%A7%E6%8A%98%E3%82%8C%E7%B7%9A%E3%82%B0%E3%83%A9%E3%83%95|ggplot2で折れ線グラフ]]
+  -[[http://i-doctor.sakura.ne.jp/dokuwiki/doku.php/ggplot2%E3%81%A7%E8%AB%96%E6%96%87%E7%94%A8%E3%81%AE%E7%99%BD%E9%BB%92%E6%8A%98%E3%82%8C%E7%B7%9A%E3%82%B0%E3%83%A9%E3%83%95|ggplot2で論文用の白黒折れ線グラフ]]
+  -[[:ggplot2でタイトルとx軸y軸の設定]]
+  -[[:Rで対応のあるt検定]]
+  -[[:Rでt検定]]
+  -[[:Rでカイ2乗検定]]
+  -[[:dplyrでデータ変換と要約]]
+  -[[:ANOVA君で分散分析]]
+  -[[:tableoneでTable1を作成]]
+  -[[:rstudio:elisa測定結果の計算|ELISAの測定結果をRStudioで計算]]
+  -[[:医療統計に関するリンク]]
+  -[[:RStudioでお勧めの本2018年版]]
+  -[[]]
+===== RStudio入門リンク =====
@@ 行 114: / 行 151: @@
-===== RStudioの使い方に関するリンク（2） =====
 ===== Rを利用するための他の方法 =====
 WindowsにRStudioをインストールする以外には、以下の方法があります。
-  -RStudio Cloudに登録する（2019年現在alpha版ですが、一番簡単です。無料です。ただし、スピードが遅い。）
+  -RStudio Cloudに登録する
-  -Google Colaboratoryに登録して、さらにRを使用できるように設定する（慣れれば簡単。ただし、スピードがやや遅い）
+  -Google Colaboratoryに登録して、さらにRを使用できるように設定する
-  -WindowsパソコンにJupyter Notebookをインストールして、さらに、Rを使用できるように設定する（最初のインストールがすごく大変で、初心者にはお勧めできない。しかし、インストールさえ終われば、スピードは早く、見やすく、個人的には最高の環境と思われます。）
+  -WindowsパソコンにJupyter Notebookをインストールして、さらに、Rを使用できるように設定する
+WindowsにRStudioをインストールするのが個人的にはお勧めです。
+==== RStudio Cloudに登録する ====
+https://rstudio.cloud
+年現在alpha版ですが、メールアドレスとパスワードを登録するだけで、Rの環境構築ができます。一番簡単です。無料です。ただし、スピードが遅いのが難点です。
+==== Google ColaboratoryでRを利用する ====
+簡単です。一番お勧めかも。以下にやり方を記載させていただきました。
+https://i-doctor.sakura.ne.jp/font/?p=41530
+GoogleColaboratoryでいきなりR環境構築
+年10月9日
+[[https://colab.research.google.com/notebooks/welcome.ipynb?hl=ja|Google Colaboratory]]に登録して、さらにRを使用できるように設定します。慣れれば簡単です。ただし、スピードがやや遅いです。
+流れ
+  -Colaboratoryで新しくノートブックを作成する
+  -Googleドライブに保存する（.ipynbファイルとして保存されます）
+  -VisualStudioCode（またはメモ帳）で開く
+"kernelspec":{"name":"python3","display_name":"Python 3"}となっている部分を書き換えて保存
+<code>
+"kernelspec":{"name":"ir","display_name":"R"}
+</code>
+Colaboratoryで編集した.ipynbファイルを開く
+参考：https://qiita.com/nozma/items/cbfffb223ef8155d04bf
+@nozma
+年04月10日に更新
+ColaboratoryでRやSwiftを使う
+==== Jupyter Notebookをインストールして、さらに、Rを使用できるように設定する ====
+https://www.anaconda.com/distribution/#download-section
+WindowsパソコンにAnaconda(Python 3.7 version, 64bit)をインストールして、さらに、Rを使用できるように設定します。
+最初のインストールに一時間くらいかかります。また、Rを使用できるようにするための設定も、慣れていないと大変で、初心者にはお勧めできません。しかし、インストールさえ終われば、スピードは早く、見やすく、個人的には最高の環境と思われます。
+流れ
+  -Anacondaをインストール
+  -Rをインストール
+  -コマンドプロプトで、IR Kernelをインストール（Jupyter NotebookでR使用できるようにするため）
+参考：https://codezine.jp/article/detail/10917
+本格的なPythonデータ解析環境を手軽に！ 「Jupyter Notebook」の導入から可視化まで
+Pythonによるデータ解析入門 第1回
+WINGSプロジェクト 西 潤史郎[著] / 山田 祥寛[監修]
+/07/02
+http://waitingforthesnark.blogspot.com/2017/04/jupyter-notebookrwindows.html?m=1
+/04/30
+Jupyter NotebookでRを動かす(windows)
+https://kato-robotics.hatenablog.com/entry/2018/03/26/171754
+-03-26
+Rの始め方 (Windows, Jupyter notebook)
-上の1と2は、常時インターネット接続している必要もあり(バックアップという意味ではよいのですが)、インストールのしやすさ、レポート出力のしやすさの観点から、WindowsにRStudioをインストールするのが個人的にはお勧めです。
 ===== リンク =====
@@ 行 129: / 行 229: @@
 前：[[00.初めての医療統計rとezr:01.ezr_とr_のインストール|01.EZR（とR）のインストール]]
-次：
+次：[[00.初めての医療統計rとezr:03.excelでcsv出力|03.Excelでcsv形式でデータを保存]]