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--- 00.初めての医療統計rとezr:19.rでrepeatedmeasuresanova [2021/06/17] – [19.RでRepeated Measures ANOVA　反復測定分散分析] adash333
+++ 00.初めての医療統計rとezr:19.rでrepeatedmeasuresanova [2023/01/18] (現在) – [参考文献] adash333
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 [[00.初めての医療統計rとezr:index.html|初めての医療統計RとEZRトップページ]]
+===== EZRでezr-repeated-measures-anova =====
+https://haru-reha.com/ezr-repeated-measures-anova/
+EZRで反復測定分散分析（repeated-measures-ANOVA）を行う方法①
+.12.07
+→分かりやすい！
+===== ソースコード =====
+https://colab.research.google.com/drive/1XSBY6hiXNXOWUUmw_X3dSVCqDYwzq_3G?usp=sharing
+_RepeatedMeasuredANOVA.ipynb
 ===== 対応のある3群以上の平均値の比較。正規分布に従い、等分散であり、球面性がある？場合のみ、Repeated Measures ANOVA =====
-正規分布に従わないのであれば、ノンバラメトリック検定である、フリードマン検定を行う
+正規分布に従わないのであれば、ノンパラメトリック検定である、フリードマン検定を行う
+http://mizumot.com/handbook/?page_id=422
+Rを使った分析（ノンパラメトリック検定）
+stack()関数
+https://yaginogogo.hatenablog.jp/entry/2016/04/22/011327
+Rむけのデータ表を作る
+→pivot_longerとの違いは？
+===== 正規分布の確認 =====
+今回は、HbA1cの経過を時系列変化で有意に下がっているかどうかを検定します。
+{{ :00.初めての医療統計rとezr:book2.xlsx |}}
+{{:00.初めての医療統計rとezr:pasted:20220323-143106.png}}
+{{ :00.初めての医療統計rとezr:book2.csv |}}
+反復測定分散分析はパラメトリック検定
+  -正規分布
+  -等分散性
+の確認が必要。
+各群が正規分布しているかどうかを、Kolmogorov-Smirnov検定する
+<code>
+library(tidyverse)
+d <- tribble(
+  ~ID,~age,~sex,~DM,~HbA1c00M,~HbA1c01M,~HbA1c02M,~HbA1c03M,
+,56,"M",1,7.3,7.4,7.3,7.4,
+,77,"F",1,8.3,8.4,8.3,8.2,
+,68,"M",1,7.1,7,7,7,
+,81,"F",1,7.6,7.4,7.3,7.4,
+,42,"M",1,10.1,8.4,7.3,6.5,
+,65,"M",1,6.1,6.2,6.2,6.3,
+,68,"F",1,7.8,7.4,7.9,8.4
+)
+d
+</code>
+{{:00.初めての医療統計rとezr:pasted:20220323-150024.png}}
+<code>
+# データの取り込み
+library(tidyverse)
+d <- read_csv("book2.csv")
+d
+# 正規性の検定 Kolmogorov-Smirnov test
+# p>=0.05 であれば、正規分布に従っているとみなすことができる
+vx <- d$HbA1c00M
+ks.test(x=vx,y="pnorm",mean=mean(vx),sd=sd(vx))
+</code>
+{{:00.初めての医療統計rとezr:pasted:20220323-145949.png}}
+https://data-science.gr.jp/implementation/ist_r_kolmogorov_smirnov_test.html
+Rによるコルモゴロフ・スミルノフ検定
+===== モークリーの球面性の検定 =====
+Mauchly Tests for Sphericity
+等分散性の確認。
+https://www.r-bloggers.com/2021/04/repeated-measures-of-anova-in-r-complete-tutorial/
+Repeated Measures of ANOVA in R Complete Tutorial
+Posted by finnstats
+https://yusuke-ujitoko.hatenablog.com/entry/2018/11/29/000314
+RでMauchly’s sphericity testを行う
+-11-29
+https://www.datanovia.com/en/lessons/mauchlys-test-of-sphericity-in-r
+Mauchly’s Test of Sphericity in R
+https://bellcurve.jp/statistics/glossary/2194.html
+Mauchlyの球面性検定
+Mauchly's sphericity test
 ===== ソースコード =====
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 https://foxglovetree.wiki.fc2.com/wiki/Programming.R.anova
 分散分析(ANOVA)をする
+https://www.takuro-fujita.com/?p=747
+Rで一元配置分散分析（対応あり）
+投稿日時: 2012-08-13
+http://babybear.site/anova.html
+分散分析(analysis of variance: ANOVA)
+ANOVAとは
+https://mikuhatsune.hatenadiary.com/entry/20160530/1464615103
+時系列データにt 検定を行う
+20160530