00.初めての医療統計rとezr:19.rでrepeatedmeasuresanova
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00.初めての医療統計rとezr:19.rでrepeatedmeasuresanova [2022/03/23] – [19.RでRepeated Measures ANOVA 反復測定分散分析] adash333 | 00.初めての医療統計rとezr:19.rでrepeatedmeasuresanova [2023/01/18] (現在) – [参考文献] adash333 | ||
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===== EZRでezr-repeated-measures-anova ===== | ===== EZRでezr-repeated-measures-anova ===== | ||
https:// | https:// | ||
+ | EZRで反復測定分散分析(repeated-measures-ANOVA)を行う方法① | ||
+ | | ||
+ | →分かりやすい! | ||
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+ | ===== ソースコード ===== | ||
+ | https:// | ||
+ | 220323_RepeatedMeasuredANOVA.ipynb | ||
===== 対応のある3群以上の平均値の比較。正規分布に従い、等分散であり、球面性がある?場合のみ、Repeated Measures ANOVA ===== | ===== 対応のある3群以上の平均値の比較。正規分布に従い、等分散であり、球面性がある?場合のみ、Repeated Measures ANOVA ===== | ||
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Rむけのデータ表を作る | Rむけのデータ表を作る | ||
→pivot_longerとの違いは? | →pivot_longerとの違いは? | ||
+ | |||
+ | ===== 正規分布の確認 ===== | ||
+ | 今回は、HbA1cの経過を時系列変化で有意に下がっているかどうかを検定します。 | ||
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+ | {{ : | ||
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+ | {{: | ||
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+ | {{ : | ||
+ | |||
+ | 反復測定分散分析はパラメトリック検定 | ||
+ | -正規分布 | ||
+ | -等分散性 | ||
+ | の確認が必要。 | ||
+ | |||
+ | 各群が正規分布しているかどうかを、Kolmogorov-Smirnov検定する | ||
+ | |||
+ | < | ||
+ | library(tidyverse) | ||
+ | d <- tribble( | ||
+ | ~ID, | ||
+ | 1, | ||
+ | 2, | ||
+ | 3, | ||
+ | 4, | ||
+ | 5, | ||
+ | 6, | ||
+ | 7, | ||
+ | ) | ||
+ | d | ||
+ | </ | ||
+ | |||
+ | {{: | ||
+ | |||
+ | |||
+ | < | ||
+ | # データの取り込み | ||
+ | library(tidyverse) | ||
+ | d <- read_csv(" | ||
+ | d | ||
+ | |||
+ | # 正規性の検定 Kolmogorov-Smirnov test | ||
+ | # p>=0.05 であれば、正規分布に従っているとみなすことができる | ||
+ | vx <- d$HbA1c00M | ||
+ | ks.test(x=vx, | ||
+ | </ | ||
+ | |||
+ | {{: | ||
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+ | https:// | ||
+ | Rによるコルモゴロフ・スミルノフ検定 | ||
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+ | ===== モークリーの球面性の検定 ===== | ||
+ | Mauchly Tests for Sphericity | ||
+ | 等分散性の確認。 | ||
+ | |||
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+ | |||
+ | https:// | ||
+ | Repeated Measures of ANOVA in R Complete Tutorial | ||
+ | Posted by finnstats | ||
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+ | https:// | ||
+ | RでMauchly’s sphericity testを行う | ||
+ | 2018-11-29 | ||
+ | |||
+ | https:// | ||
+ | Mauchly’s Test of Sphericity in R | ||
+ | |||
+ | https:// | ||
+ | Mauchlyの球面性検定 | ||
+ | Mauchly' | ||
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Rで一元配置分散分析(対応あり) | Rで一元配置分散分析(対応あり) | ||
投稿日時: | 投稿日時: | ||
+ | |||
+ | http:// | ||
+ | 分散分析(analysis of variance: ANOVA) | ||
+ | ANOVAとは | ||
+ | |||
+ | https:// | ||
+ | 時系列データにt 検定を行う | ||
+ | 20160530 | ||
00.初めての医療統計rとezr/19.rでrepeatedmeasuresanova.1648031032.txt.gz · 最終更新: 2022/03/23 by adash333