UCSCでBACを表示させる方法
(1)geneのところで検索。たとえば「rhodopsin」→「Subm it」
(2)目的の遺伝子を選ぶ。
(3)「BAC End Pairs」のところを「hide」から、「Full」にして、「reflesh ...
次世代シーケンサー解析サービスの価格
シーケンサー 1人のヒトゲノムを読むのに必要な値段。2011/9/22時点
アメリカ:40万円(Science 2009の論文)
2011年5月現在、Illumina社が会員限定だが40万円でサービス開始。
exome sequencingなど
Aluとは・・・
レトロトランスポゾン
動物遺伝系大学院留学記
エクソーム解析によってメディカルゲノミクス
geneとcoding sequence
RT-PCR配列 イントロンを含むかどうかの検索法
ヒトの遺伝子が何個あるのか知りたい場合、
のを見ればよいと思われるが、どれがその個数なのかわからない。
CCDS (consensus
塩基配列の比較、アミノ酸配列の比較
(例題)マウスのVEGF-Aのタンパクの、368aaの配列と、392aaの配列を比較する。
(1)Ensemblで、VEGFAを検索
(2)図のLength (aa)を見て、今回は、Vegfa-001 (368 ...
相同性検索(2)
●基本的知識
●手元にある2つのアミノ酸配列のアラインメント
(1)blastを用いる方法
→E-valueを算出してくれるが、残基一致率は出してくれない。
がーん。
...
相同性検索
奈良先端科学技術大学院大学平成21年度「ゲノムリテラシー講座」配列相同性検索 演習
←これが一番最初に読むべき資料か?
相同性検索の原理について
ほとんど分からないが、面白