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EZRで『.rda』データをインポートするときは「ファイル」>「既存のデータセットを読み込む」をクリック

EZRで『FCZ_CSA.rda』などの、.rdaデータ(R形式データ)をインポートするときは

(1)「ファイル」>「既存のデータセットを読み込む」をクリック

(2)開きたいファイル(今回は、 『FCZ_CSA.rda』 )を選択して『開く』をクリックすると、rdaファイルを開くことができます。

(3)『表示』をクリックすると、インポートしたデータを確認することができます。

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きっかけ

EZRで「線形混合モデル」の解析をするために、『EZRでやさしく学ぶ統計学 改訂3版 〜EBMの実践から臨床研究まで〜 単行本(ソフトカバー) – 2020/11/16』を購入しました。

本の内容を写経するために、付属のCD-ROMの中身の『.rda』ファイルをEZRにインポートしようとしたのですが、ググっても数時間わからなかったのですが、簡単でした。

開発環境

Windows10 Pro (1909)
EZR 1.50 (June 4, 2020)

WindowsへのEZRのインストールは、https://www.jichi.ac.jp/saitama-sct/SaitamaHP.files/download.html からインストーラーをダウンロードしてダブルクリックして進めるのみです。

エクセルのデータをEZRで読み込むための手順

参考:03.Excelでcsv形式でデータを保存

EZRやRで統計解析を行う場合、

  1. Excelでデータを集める(xlsx形式で保存)
  2. データを『名前をつけて保存』でcsv形式で保存
  3. EZRでcsvファイルを読み込む
  4. EZRで解析

といった手順を踏むのがスムーズです。

なお、CSV形式で保存するときですが、

  • Windowsの場合は、『CSV(コンマ区切り)(*.csv)』で保存(Shift-JIS でエンコード)
20171126-110811.png
  • MacやColaboratory用に保存するときは、『CSV UTF-8(コンマ区切り)(*.csv)』で保存(UTF-8 でエンコード)

となります。2021年現在、WebやMac, Linuxなどのほとんどの文字のエンコード形式は、『UTF-8』が主流ですが、相変わらず、Windowsは『Shift-JIS』であり、文字化けの原因となっています。

なお、EZR用にExcelでデータを保存するときの注意点ですが、

  1. 1行目に、一番左から項目を羅列する
  2. 1行目は空欄は作らない。
  3. 1行目の項目は半角英字で始まり、2文字目以降は半角英数字またはピリオドのみ。
  4. 2行目以降は、1行につき、1症例のデータを記載する
  5. 2行目以降でデータが無いセルは『NA』と記載する。

1.2.4は譲れない点です。3.5は、後日、t検定などをおこなうために統計ソフトEZRやRを利用するための準備です。エクセルのみ使用する場合は必須ではありません。

具体的には、以下のような感じです。

20171124-002809.png

これをEZRで読み込みます。(参考:EZR用にExcelでデータを保存するときの注意点とcsv出力

ファイル > 名前をつけて保存 のあと、

CSV形式(コンマ区切り)(*.csv)  形式で保存します。

EZRを起動し、 ファイル > データのインポート > ファイルまたはクリップボード、URLからテキストデータを読み込む をクリック

下のようになっていることを確認(特に、『フィールドの区切り記号』が『カンマ』が大事)し、OK をクリック

先ほど保存したcsvファイル(今回は、Book1.csv)を選択して、開く をクリック。

表示 をクリックすると、中身を確認できます。

EZRのデータセットをcsvファイルで出力したいときは

EZR上で、アクティブデータセット > 変数の操作 などでデータセットを編集したりした場合(wide format 横長データ を long format 縦長データ(tidy data)に変換したりできます。)、編集後のデータセットを.rda形式で保存(ファイル > アクティブデータセットを保存する)してもよいのですが、csv形式で保存したい場合は

アクティブデータセット > アクティブデータセットの更新・保存 > アクティブデータセットをエクスポート(Text形式)をクリックし、保存画面で拡張子を『.csv』にする

と、簡単にcsv形式でエクスポートできます。

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R

Posted by twosquirrel