03.Excelでcsv形式でデータを保存

—2019/10/10 更新
前回の02.RStudioのインストールでは、WindowsパソコンでRを使用できるようにしました。今回は、自作データをRで利用できるようにするためのデータの作成方法について記載させて頂きます。

EZRやRで統計解析を行う場合、

Excelでデータを集める(xlsx形式で保存)
データを『名前をつけて保存』でcsv形式で保存
Rでcsvファイルを読み込む
Rで解析

といった手順を踏むのがスムーズです。

以下に記載させて頂きました。

エクセルで統計データを集計するときにお勧めの記載方法

EZRやRでデータを取り込むときにスムーズに行くように、以下のようにデータ集めしていくのがお勧めです。

ID	age	sex	DM	height	weight	group
00001	56	M	1	169	60	A
00002	77	F	1	156	69	A
00003	68	M	0	178	67	A
00004	81	F	1	165	71	A
00005	72	M	0	178	67	B
00006	65	M	0	167	53	B
00007	68	F	0	156	50	B

エクセルの画面では以下のようになります。

book1.xlsx

ルールを文章化すると、以下のようになります。

1行目に、一番左から項目を羅列する
1行目は空欄を作らない
1行目の項目は半角英字で始まり、2文字目以降は半角英数字またはピリオドのみ
2行目以降は、1行につき、1症例のデータを記載する。
2行目以降でデータが無いセルは『NA』(半角の英語の大文字のNとA)と記載する。

1.2.4は譲れない点です。3.5は、後日、t検定などをおこなうために統計ソフトEZRやRを利用するための準備です。エクセルのみ使用する場合は必須ではありません。

なお、Rは大文字と小文字を別の文字として認識します。

NAはデータ無しという意味ですが、

Not Applicable：該当なし
Not Available：利用不可、入手不可

の略語だそうです。

readxlでエクセルデータをRにインポート

https://qiita.com/tayohei@github/items/4b5170cc12f5a5084abe
@tayohei@github
2018年01月08日に更新
readxlでe-statのExcelデータを読んでみる

#インストール未であれば、tidyverseをインストール
install.library("tidyverse")

# libraryの読み込み
library("tidyverse")
library("readxl")

# エクセルファイルの場所
working_dir ="C:/R/sample"  # 作業ディレクトリ名
input_file  ="./book1.xlsx"  # 読み込むファイル名
setwd(working_dir)

# なにはともあれ読み込む
input_data <- read_excel(input_file,trim_ws=T,sheet=1)

リンク

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