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00.初めての医療統計rとezr:03.excelでcsv出力


文書の過去の版を表示しています。


03.Excelでcsv形式でデータを保存

EZRやRで統計解析を行う場合、

  1. Excelでデータを集める(xlsx形式で保存)
  2. データを『名前をつけて保存』でcsv形式で保存
  3. Rでcsvファイルを読み込む
  4. Rで解析

といった手順を踏むのがスムーズです。

以下に記載させて頂きました。

EZR用にExcelでデータを保存するときの注意点とcsv出力

エクセルで統計データを集計するときにお勧めの記載方法

EZRやRでデータを取り込むときにスムーズに行くように、以下のようにデータ集めしていくのがお勧めです。

ID age sex DM height weight group
00001 56 M 1 169 60 A
00002 77 F 1 156 69 A
00003 68 M 0 178 67 A
00004 81 F 1 165 71 A
00005 72 M 0 178 67 B
00006 65 M 0 167 53 B
00007 68 F 0 156 50 B

エクセルの画面では以下のようになります。

ルールを文章化すると、以下のようになります。

  1. 1行目に、一番左から項目を羅列する
  2. 1行目は空欄を作らない
  3. 1行目の項目は半角英字で始まり、2文字目以降は半角英数字またはピリオドのみ
  4. 2行目以降は、1行につき、1症例のデータを記載する。
  5. 2行目以降でデータが無いセルは『NA』(半角の英語の大文字のNとA)と記載する。

1.2.4は譲れない点です。3.5は、後日、t検定などをおこなうために統計ソフトEZRやRを利用するための準備です。エクセルのみ使用する場合は必須ではありません。

なお、Rは大文字と小文字を別の文字として認識します。

NAはデータ無しという意味ですが、

  • Not Applicable:該当なし
  • Not Available:利用不可、入手不可

の略語だそうです。

リンク


00.初めての医療統計rとezr/03.excelでcsv出力.1570665677.txt.gz · 最終更新: 2019/10/10 by adash333

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