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00.初めての医療統計rとezr:17.rでt検定


文書の過去の版を表示しています。


17. Rでt検定

ソースコード

対応のない2群の比較検定にはStudentのt検定、ウェルチのt検定とマン・ホイットニ検定がある

2群の平均に有意に差があるか検定したいとき

(Q1) 2群に対応があるか?(独立でないか?独立か?)

2群に対応がある場合 → 18.Rで対応のあるt検定

2群に対応がない場合(独立である場合) → 分布が正規分布に従うか調べる

(Q2) 2群が正規分布に従うか?

2群が正規分布に従う場合 → 2群が当分散か調べる

2群が正規分布に従わない場合 → マン・ホイットニ検定

vx=c(12,15,53,65,24,75,100,66,43,52,68,42)
shapiro.test(x=vx)

https://data-science.gr.jp/implementation/ist_r_shapiro_wilk_test.html
Rによるシャピロ・ウィルク検定

(Q3) 2群が正規分布に従い、かつ等分散とみなせるときはStudentのt検定

2群が正規分布に従い、かつ等分散の場合 → Studentのt検定

t.test(x, y, var.equal=T)

2群が正規分布に従い、等分散とは限らない場合(等分散でも使用してよい) → ウェルチのt検定

# Rのt.test()関数のデフォルトはvar.equal=F、つまりウェルチのt検定になっている
t.test(x, y)

xとyが等分散であるかどうかの検定(F検定)

var.test(x, y)
# この結果がp>0.05であれば、xとyは等分散と言えるので、
# その場合は、student t-testを用いることができる
# 等分散か判定するのが面倒であれば、
# 毎回ウェルチのt検定を使うのもありか

メモ

http://plaza.umin.ac.jp/~beehappy/stat/test-2g.html
私のための統計処理

(1)正規性を示し、かつ等分散:Student t-test:スチューデントのt検定(平均値を比較)
(2)正規性を示すが、等分散でなくても良い:Welch's t test:ウェルチのt検定(平均値を比較)
(3)正規分布、等分散でなくても良い:Mann-Whitney's U test:マン・ホイットニ検定(Wilcoxon rank sum test)(中央値を比較)

参考リンク

リンク


00.初めての医療統計rとezr/17.rでt検定.1597132737.txt.gz · 最終更新: 2020/08/11 by adash333

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