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サルでもわかる機械学習

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00.covid19:200415_sars-cov-2


200415 SARS-CoV-2というウイルス

概要

https://www.jiu.ac.jp/features/detail/id=6822
コロナウイルスの構造と複製サイクル(ライフサイクル)
→すごく具体的で図も分かりやすい

https://www.eiken.co.jp/uploads/modern_media/literature/P11-18.pdf
D614G変異は、S蛋白の614番目のDがGに変異したもの

https://www.riken.jp/press/2021/20210218_2/
2021年2月18日
理化学研究所
新型コロナウイルス感染の分子機構を解明
→S蛋白は糖鎖修飾されている

https://www.chemistry.or.jp/journal/ci21p499.pdf
202107
新型コロナウイルスの分子構造とその変異

  1. D614G
  2. N501Y
  3. E484K

2021年7月現在、D614G変異は当たり前。

https://www.funakoshi.co.jp/contents/67303
新型コロナウイルス変異株(E484K, N501Y, D614Gなどの変異を持つ)の組換え体スパイクタンパク質
20210517

  1. 501Y.V1(アルファ、英国型)
  2. 501Y.V2(ベータ、南アフリカ型)
  3. 501Y.V3 (ガンマ、ブラジル型)
  4. (デルタ、インド型)
  5. C.37(ラムダ株)(ペルー型)

https://www.jcl.co.jp/covheni
新型コロナウイルス変異株とは
→非常に詳しく分かりやすい

https://news.yahoo.co.jp/articles/13d735a72b3d1806d541ab568afe583adc0b46b8 (デルタ株)
デルタ株の感染力、インフルの4倍 ~「新しい危険なウイルス」~
2021/8/13(金) 18:36

https://www.niid.go.jp/niid/ja/diseases/ka/corona-virus/2019-ncov/2484-idsc/10501-covid19-48.html
伝播性の増加や抗原性の変化が懸念される新型コロナウイルス(SARS-CoV-2)の新規変異株について (第10報)
国立感染症研究所
2021年7月6日18:00時点

WHOはC.37系統の変異株(ラムダ株)を注目すべき変異株(VOIs; Variant of Interest)に位置付けた。

https://ja.m.wikipedia.org/wiki/SARS%E3%82%B3%E3%83%AD%E3%83%8A%E3%82%A6%E3%82%A4%E3%83%AB%E3%82%B92-%E3%83%A9%E3%83%A0%E3%83%80%E6%A0%AA
ラムダ株(ペルー株)

https://news.yahoo.co.jp/byline/minesotaro/20200421-00174406/
どんなウイルスで、どのように感染するのか? 新型コロナウイルスのそもそも論
峰宗太郎 | 医師(病理専門医)・薬剤師・研究者
4/21(火) 8:59

https://ja.wikipedia.org/wiki/2019%E6%96%B0%E5%9E%8B%E3%82%B3%E3%83%AD%E3%83%8A%E3%82%A6%E3%82%A4%E3%83%AB%E3%82%B9
Wikipedia 新型コロナウイルス

https://www.jmedj.co.jp/journal/paper/detail.php?id=14354
緊急寄稿(3)新型コロナウイルス感染症(COVID-19)を含むウイルス感染症と抗ウイルス薬の作用の特徴(白木公康)
2020-04-01

https://note.stopcovid19.jp/?gs=75b556794627
コロナ専門家 有志の会

http://www.med.or.jp/doctor/kansen/novel_corona/009082.html
日本医師会 新型コロナウイルス感染症
→新型コロナウイルス感染症外来診療ガイド(第1版)【日本医師会】や、日本医師会 COVID-19有識者会議 など、分かりやすい

202108

https://www.jiji.com/sp/article?k=2021083000595&g=soc
新たなデルタ株を初確認 アルファ株の類似変異も―東京医科歯科大
2021年08月30日

同大によると、新たなデルタ株は今月、同大付属病院の患者から検出された。デルタ株に特徴的な「L452R」変異に加え、アルファ株に特徴的な「N501Y」に類似した「N501S」変異があった。患者に海外渡航歴はなく、市中感染だったという。同大は、この変異は国内で起きた可能性が極めて高いとみている。

抗体依存性免疫増強ADE

その他

https://jp.sputniknews.com/covid-19/202005077427069/
200個近いコロナウイルスの突然変異が発見
新型コロナウイルス
2020年05月07日 03:05

https://nazology.net/archives/57616
高齢者の重症化原因? 新型コロナは全身の血管に感染することが判明
2020/04/23

https://www.thelancet.com/journals/lancet/article/PIIS0140-6736%2820%2930937-5/fulltext#sec1
Endothelial cell infection and endotheliitis in COVID-19

https://nazology.net/archives/56567
新型コロナウイルスは「免疫細胞を無効化する」という研究結果
2020/04/13

https://www.nature.com/articles/s41423-020-0424-9

パイロトーシス

http://dimb.w3.kanazawa-u.ac.jp/sousetsuf/sousetsu13.htm
パイロトーシス:新しいネクローシス様プログラム細胞死
医学のあゆみ 2013, 246:432-437

重症化リスク

https://news.yahoo.co.jp/byline/inosehijiri/20200412-00172864/
新型コロナの重症化リスク、肥満要因が鮮明に
猪瀬聖 | ジャーナリスト
4/12(日) 11:00

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00.covid19/200415_sars-cov-2.txt · 最終更新: 2021/08/30 by adash333