JupyterLabでR環境構築

2019年10月26日2020年2月5日

前回は、Windows10にAnacondaをインストールして、JupyterLabでPython 3.7 を利用するところまでをやりました。

Windows10にAnacondaをインストールしてPython3.7環境を構築してみる

今回は、JupyterLabでRを使用できるようにしてみたいと思います。以下のサイトを写経してみます。

Contents

開発環境

Windows 10 Pro (1803)
Chrome
Anaconda 2019.10 for Windows InstallerでAnacondaをインストール
Python 3.7
Anaconda Navigator 1.9.7
JupyterLab 1.1.4

Windowsボタン > Anaconda3(64 bit) > Anaconda Prompt(Anaconda3)　の順にクリックして、Anaconda Promptを起動します。

以下のような画面が出てきます。

Anaconda Promptの画面で以下を入力し、IRKEernelをインストールします。

conda install -c r r-irkernel

Proceed?と聞かれたら、Enterを押します。

以下のようになるので、Anaconda Promptを閉じます。

Windowsボタン > Anaconda3(64 bit) > Anaconda Navigator(Anaconda3)　の順にクリックして、Anaconda Navigatorを起動します。

JupyterLab　を起動します。

Launcher タブで、Notebook　のところに、Python3とRが表示されるので、R　をクリックします。

以下のような画面になります。

以下を入力して、『Shift + Enter』を押します。

x <- 1
x

ちゃんと、Rが使用できていることが分かりました。

File > Save Notebook As…　の順にクリック

『r/191026_hello-r.ipynb』と入れて、Save　をクリック

以下のように、保存されます。

今回はここまでとなります。

tidyverseなどのパッケージをインストールするときには、以下のように入力してから、『Shift+Enter』するとよさそうです。

install.packages("tidyverse")

インストールに10分程度かかります。

無事、tidyverseがインストールできたようです。

library(tidyverse)
iris %>% head

html出力は、

File > Export Notebook As… > Export Notebook to HTML

の順にクリックすれば、すぐにできるのですが、PDF出力をするためには、何か設定が必要のようです。

別の環境では、上記の方法でうまくいきませんでした。

以下の方法（RのPATHを直接指定する）で行うと、うまくいったことがありました。