目次
初めての医療統計RとEZRトップページ
Windowsでcsvファイルを扱うときは、
- Google Colaboratoryで用いるときは、UTF-8 で保存
- Windows上でR StudioやEZRを用いるときは、Shift-JIS で保存
に注意します。UTF-8で保存したファイルEZRで読み込んだりすると、以下のようなエラーが出て読み込めません。
なお、RStudioの場合は、UTF-8のファイルを読み込むこともできます。
→ https://shohei-doi.github.io/quant_polisci/encoding-r.html
# 標準関数の場合
read.csv("data/data_utf8.csv", fileEncoding = "utf8")
# tidyverseの場合
library(tidyverse)
read_csv("data/data_utf8.csv", locale = locale(encoding = "utf8"))
04.GoogleColaboratoryでRプログラミング
06.Colaboratoryで時系列データでRで折れ線グラフ
見出し
RとEZR
Rは、統計解析用プログラミング言語です。無料で、ほとんどの統計解析を行うことができます。
R言語をベースにした、クリック操作による統計解析ソフトがEZRです。最初はこちらがお勧めです。
しかし、統計データの一部に変更が生じたり、データが追加された場合、EZRだと、最初から統計をやり直さないといけません。EZRに慣れてきたら、RStudioを用いて、Rで統計解析を行うと、データに変更があってと、かなり楽に統計解析のやり直しを行うことができます。
論文掲載可能なフリーソフトEZR
初めて統計をしようとする人にとっては、『どのようなときに、どの手法を使えばよいのか？』というところが分からないものです。しかし、2015年に発売された初心者でもすぐにできるフリー統計ソフトEZR(Easy R)で誰でも簡単統計解析には、具体的な実例とともに、例えば、t検定を行ってよい条件や、実際のt検定のやり方、結果の解釈の仕方などが簡潔に分かりやすく書かれており、統計の本の中で一番のお勧めです。
ちなみに、論文のMethodには、
All statistical analyses were performed with EZR (Saitama Medical Center, Jichi Medical University, Saitama, Japan), a graphical user interface for R 2.13.0 (R Foundation for Statistical Computing, Vienna, Austria) [19]. More precisely, EZR is a modified version of R commander (version 1.6-3) designed to add statistical functions used frequently used in biostatistics.
と記載すればよいようです。
引用文献としては、以下を記載すればよいそうです。
Bone Marrow Transplantation 2013: 48, 452–458
RStudioで医療統計のお勧めの本
上記のEZRの本で、どのようなときにどんな統計を用いたらよいかを調べつつ、実際に論文を書くときは、以下の本で、RStudioを用いて統計を行うのがお勧めです。
この本の通りにやれば、初心者でもRプログラミングを用いた統計を行うことができます！
ggplot2(tidyverse)でグラフを描くのであれば
以下の本は必携です！
http://delta0726.web.fc2.com/book/ggplot2/00_ggplot2.html
Ｒグラフィックス・クックブック
統計を用いて論文をかくために読んでおくとよさそうなサイト
https://qiita.com/KentaroUeda/items/946d58cd7a93be7bd9d7
@KentaroUeda
2020年05月04日に更新
新卒専用 Advent Calendar 201720日目
統計学をツールとして利用する時に参考になるサイトまとめ
https://oku.edu.mie-u.ac.jp/~okumura/stat/
統計・データ解析
奥村 晴彦
→Rの使い方 超お勧め