02_画像から数値へ

03 数値から画像へ

04 2点間の距離を測定

05　画像の2値化

以下の本を参考に、Windowsパソコンに、ImageJをインストールしてみます。
P270の付録１を参考に、Fijiというものをインストールしてみたい。
2014年から、ImageJ2というものがあるらしい。。。どっちをインストールするのかはこれから考えます。

Windows8.1 Pro

今回構築した環境

ImageJ本体に、ある程度プラグインを付属したものが、Fijiというものだそうです。
初心者は、とりあえず、Fijiをインストールすればよいと思われます。

• C:/ フォルダに、C:/software/ フォルダを作成しておきます。
• Fijiのサイトhttps://imagej.net/Fiji/Downloads へ行きます。

• Windowsのマークの64bitの方をクリックして、インストーラーをダウンロードします。
• インストーラーは、2019/4/14時点では、fiji-win64.zipという名前で、289MBあり、私の環境ではダウンロードに10分程度かかりました。
• ダウンロードできたら、ダブルクリックして、ZIPファイルを解凍

• 中身のFiji.appフォルダを、C:/software/ フォルダ（または、デスクトップ）に移動（コピー）
• C:/software/Fiji.app/ フォルダの中の、ImageJ-win64.exe　をダブルクリックすると、ImageJ(Fiji)が起動します。（特にインストールなどは必要ありません。）

• 以下のようなツールバーが表示されます。このツールバーから、いろいろな操作を行うことになります。

ImageJではじめる生物画像解析(2016/3/26)のP13の、「解析の準備」に従い、Fijiでのプラグインのアップデートとインストールを行ってみます。

• C:/software/Fiji.app/ImageJ-win64.exe をダブルクリックして、ImageJを起動。

• Help > Update… をクリック

• 自動的にUpdateされるので、しばらく待ちます

• Updateが終了すると、以下のような画面になるので、画面左下の“Manage update sites”をクリック

• Manage update sitesの画面が出てくるので、少し下の方へ行き、“CMCI-EMBL”のチャックボックスをONにします。

• 画面右下の“Close”をクリックすると、以下のような画面になるので、画面下の“Apply changes”をクリック。
• すると、数秒で以下のような画面になるので、“OK”をクリックします。

• ImageJのメニューバーで、File > Quit　をクリックして、ImageJを終了します。

• C:/software/Fiji.app/ImageJ-win64.exe をダブルクリックして、ImageJを起動します。上記の操作により、ImageJのプラグインのアップデートと、CMCI-EMBLプラグインのインストールを行うことができました。

• ImageJを起動すると、メニューバーの一番右に、“EMBL”という項目が増えています。

Fiji Updaterについて
https://imagej.net/Updater

http://scienceandtechnology.jp/archives/25990
Image J / Fiji のダウンロード方法、インストール方法と使い方
2019/01/11 2019/04/05

imagej:index.html

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